RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587016.5

HDGFL2-201, Transcript of HDGF like 2, humanhuman

TSL 3

Gene HDGFL2, Length 870 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL2-201ENST00000587016 CLCN3P51790 818 aa20.86■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 RASIP1Q5U651 963 aa20.86■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.86■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 PNMA5Q96PV4 448 aa20.86■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.86■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.86■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 SPTLC2O15270 562 aa20.85■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 GPR32O75388 356 aa20.85■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 GRB10Q13322 594 aa20.85■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 XKR9Q5GH70 373 aa20.85■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 TMEM240Q5SV17 173 aa20.85■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.85■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.85■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 CSRNP2Q9H175 543 aa20.85■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.85■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.85■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 CFAP45Q9UL16 551 aa20.85■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.85■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 TRPV2Q9Y5S1 764 aa20.85■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 CDY2AQ9Y6F7 541 aa20.85■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 DGAT1O75907 488 aa20.84■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 TMOD1P28289 359 aa20.84■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 DRP2Q13474 957 aa20.84■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 STK38Q15208 465 aa20.84■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 IER5Q5VY09 327 aa20.84■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.84■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 KCNK18Q7Z418 384 aa20.84■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 CABP7Q86V35 215 aa20.84■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.84■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.84■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 SLC7A3Q8WY07 619 aa20.84■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.84■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.84■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 EYA4O95677 639 aa20.83■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 CTSHP09668 335 aa20.83■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 EMC2Q15006 297 aa20.83■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.83■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 FBXO47Q5MNV8 452 aa20.83■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 LRRC15Q8TF66 581 aa20.83■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 MAP7D2Q96T17 732 aa20.83■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.934e-7■■■□□ 15.1
HDGFL2-201ENST00000587016 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 ADAMTS10Q9H324 1103 aa20.83■□□□□ 0.93
HDGFL2-201ENST00000587016 GPC3P51654 580 aa20.82■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 LPIN1Q14693 890 aa20.82■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 USP49Q70CQ1 688 aa20.82■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 TDHQ8IZJ6 230 aa20.82■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 METTL13Q8N6R0 699 aa20.82■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 USP38Q8NB14 1042 aa20.82■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 HERVK_113Q902F9 699 aa20.82■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 CLIC6Q96NY7 704 aa20.82■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 MTRQ99707 1265 aa20.82■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 LAMA3Q16787 3333 aa20.81■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 VTNP04004 478 aa20.81■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 UBA7P41226 1012 aa20.81■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 KRT85P78386 507 aa20.81■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 CDC42EP1Q00587 391 aa20.81■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.81■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.81■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.81■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 ZNF410Q86VK4 478 aa20.81■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.81■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.81■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.81■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 E9PMD0 336 aa20.8■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 M0QZ92 97 aa20.8■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 CUTAO60888 179 aa20.8■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 BAIAP3O94812 1187 aa20.8■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 CYP11B2P19099 503 aa20.8■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 TCTN1Q2MV58 587 aa20.8■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 ZNF365Q70YC5 407 aa20.8■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.8■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.8■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 TCP11Q8WWU5 503 aa20.8■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 EPSTI1Q96J88 318 aa20.8■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.8■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.8■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.8■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 DNM3Q9UQ16 869 aa20.8■□□□□ 0.92
HDGFL2-201ENST00000587016 A0A087WWV3 80 aa20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms