RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586541.5

PRKAR1A-212, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene PRKAR1A, Length 570 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-212ENST00000586541 LGR4Q9BXB1 951 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 HDAC8Q9BY41 377 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 ECHDC1Q9NTX5 307 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 PRR13Q9NZ81 148 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 VAV3Q9UKW4 847 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 SH3TC1Q8TE82 1336 aa6.51□□□□□ -1.37
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PRKAR1A-212ENST00000586541 MYH13Q9UKX3 1938 aa6.51□□□□□ -1.37
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PRKAR1A-212ENST00000586541 HIP1O00291 1037 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 FOXN1O15353 648 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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PRKAR1A-212ENST00000586541 AK2P54819 239 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 CXCL9Q07325 125 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 MTERF2Q49AM1 385 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.51□□□□□ -1.37
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PRKAR1A-212ENST00000586541 ZSCAN30Q86W11 494 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.51□□□□□ -1.37
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PRKAR1A-212ENST00000586541 TCTN2Q96GX1 697 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 EPN3Q9H201 632 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 AKT3Q9Y243 479 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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PRKAR1A-212ENST00000586541 YDJCA8MPS7 323 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 CA12O43570 354 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 CASTP20810 708 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 EPS15P42566 896 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 CTSKP43235 329 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 CD97P48960 835 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 GAB4Q2WGN9 574 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 DEFB115Q30KQ5 88 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 HS1BP3Q53T59 392 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 RUFY3Q7L099 469 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 COPS6Q7L5N1 327 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 BVESQ8NE79 360 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 ASB11Q8WXH4 323 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 TM6SF1Q9BZW5 370 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 TSPY26PQ9H489 355 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 H0Y8X5 98 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 AGRPO00253 132 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 NPHP1O15259 732 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 LARGE1O95461 756 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 IGKV5-2P06315 115 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 ITGAVP06756 1048 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 MYL6BP14649 208 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 MSNP26038 577 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 NEXNQ0ZGT2 675 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.378e-14■■□□□ 11.9
PRKAR1A-212ENST00000586541 VPS53Q5VIR6 699 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 SPRED2Q7Z698 418 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 DTX1Q86Y01 620 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 CREG2Q8IUH2 290 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 CCDC191Q8NCU4 936 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 MISP3Q96FF7 219 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 KAZALD1Q96I82 304 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 DUSP13Q9UII6 198 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 SMC3Q9UQE7 1217 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 A0A0D9SFI3 127 aa6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-212ENST00000586541 A0A1W2PQU0 124 aa6.48□□□□□ -1.37
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