RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585084.5

GPS1-225, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-225	ENST00000585084	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
GPS1-225	ENST00000585084	RGS18	Q9NS28	235 aa		32.14	■■■□□ 2.74
GPS1-225	ENST00000585084		M0R2N6	131 aa		32.13	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF862	O60290	1169 aa		32.13	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	MGEA5	O60502	916 aa		32.13	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	GPR32	O75388	356 aa		32.13	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	MYO7A	Q13402	2215 aa		32.13	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	WDR81	Q562E7	1941 aa		32.13	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		32.13	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		32.13	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	RDM1	Q8NG50	284 aa		32.13	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	P2RX5	Q93086	422 aa		32.13	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	NCK2	O43639	380 aa		32.12	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	PSMD10	O75832	226 aa		32.12	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	XBP1	P17861	261 aa		32.12	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	SCRN1	Q12765	414 aa		32.12	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		32.12	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		32.12	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		32.12	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	FAM228A	Q86W67	206 aa		32.12	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		32.12	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	NPY5R	Q15761	445 aa		32.11	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	UGCG	Q16739	394 aa		32.11	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		32.11	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	NEK9	Q8TD19	979 aa		32.11	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		32.11	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		32.11	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	MMP1	P03956	469 aa		32.1	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	GATM	P50440	423 aa		32.1	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	INF2	Q27J81	1249 aa		32.1	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	CLDND1	Q9NY35	253 aa		32.1	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084		C9IYK1	514 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	CSPG5	O95196	566 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	ANAPC15	P60006	121 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	ANKRD1	Q15327	319 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	MBOAT7	Q96N66	472 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	STK36	Q9NRP7	1315 aa		32.08	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	PFKFB2	O60825	505 aa		32.08	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		32.08	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		32.08	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	SCLT1	Q96NL6	688 aa		32.08	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		32.08	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		32.08	■■■□□ 2.73
GPS1-225	ENST00000585084	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	ITGB1	P05556	798 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	COL19A1	Q14993	1142 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	LETM2	Q2VYF4	491 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	XKR3	Q5GH77	459 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	IL9	P15248	144 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	AAAS	Q9NRG9	546 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	FAM50B	Q9Y247	325 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	HYAL1	Q12794	435 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	DSC3	Q14574	896 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	MTERF2	Q49AM1	385 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	GPC3	P51654	580 aa		32.04	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	FAM189B	P81408	668 aa		32.04	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	NEK8	Q86SG6	692 aa		32.04	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	WASF1	Q92558	559 aa		32.04	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	IGFLR1	Q9H665	355 aa		32.04	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		32.03	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	SLC37A4	O43826	429 aa		32.03	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	COL9A1	P20849	921 aa		32.03	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	AK2	P54819	239 aa		32.03	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	CAMK1	Q14012	370 aa		32.03	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	POF1B	Q8WVV4	589 aa		32.03	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	NLRP7	Q8WX94	980 aa		32.03	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		32.02	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	DNAJB1	P25685	340 aa		32.02	■■■□□ 2.72

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms