RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563451.1

SNAP23-206, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 3

Gene SNAP23, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-206	ENST00000563451	KRT4	P19013	534 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	DNM2	P50570	870 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	SCD	O00767	359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	FOXP2	O15409	715 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	ADCY3	O60266	1144 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	SEC23A	Q15436	765 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451		Q6ZPA2	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	SPATC1	Q76KD6	591 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	TRAF5	O00463	557 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	CRTAM	O95727	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	SDHA	P31040	664 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	PTGS2	P35354	604 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	ADCY7	P51828	1080 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	ADAM15	Q13444	863 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-206	ENST00000563451	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	PDPK1	O15530	556 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	SCNN1G	P51170	649 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	COL10A1	Q03692	680 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	RASGRF1	Q13972	1273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451		Q6ZRM9	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	DLG3	Q92796	817 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	HAS1	Q92839	578 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	RASSF10	A6NK89	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	BMP5	P22003	454 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	MTERF2	Q49AM1	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	SLC12A8	A0AV02	714 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	EFCAB14	O75071	495 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	HIP1R	O75146	1068 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	STAT3	P40763	770 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	GAREM2	Q75VX8	874 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	XDH	P47989	1333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	GC	P02774	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	ADRA1B	P35368	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	BPIFB4	P59827	614 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	FSTL1	Q12841	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	E2F7	Q96AV8	911 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	EXOC2	Q96KP1	924 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-206	ENST00000563451	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76 ms