RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 MAN1B1Q9UKM7 699 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 JADE1Q6IE81 842 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 FBXO41Q8TF61 875 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF560Q96MR9 790 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 CARD6Q9BX69 1037 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 DONSONQ9NYP3 566 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 GGPS1O95749 300 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 DGKDQ16760 1214 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 AFAP1L1Q8TED9 768 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 TSC1Q92574 1164 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 PRRG1O14668 218 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 SLC12A1Q13621 1099 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 PPP2R5EQ16537 467 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 SFR1Q86XK3 245 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 PAGE5Q96GU1 130 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 OSBPL3Q9H4L5 887 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 CD163L1Q9NR16 1453 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 ALDH1A1P00352 501 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 KRT17Q04695 432 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 DESI2Q9BSY9 194 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 RWDD2AQ9UIY3 292 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 POTEB3A0JP26 581 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 A8MXQ7 604 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 YY1P25490 414 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 POTEBQ6S5H4 581 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 TADA2BQ86TJ2 420 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 MCUR1Q96AQ8 359 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 DCDC2CA8MYV0 355 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 BASP1P80723 227 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 NME3Q13232 169 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 AIFM3Q96NN9 605 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 THAP9Q9H5L6 903 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 AAASQ9NRG9 546 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 PPME1Q9Y570 386 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 C17orf102A2RUQ5 167 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 E9PMD0 336 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 CREB3O43889 395 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 PRKCBP05771 671 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 BTBD8Q5XKL5 378 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 GLYCTKQ8IVS8 523 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 SCYL3Q8IZE3 742 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 RNF149Q8NC42 400 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1W2PQ27 194 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1W2PQ64 194 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1W2PQD8 194 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 INHBAP08476 426 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 IRF1P10914 325 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 STX2P32856 288 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 GNASQ5JWF2 1037 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 LRRD1A4D1F6 860 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 APOEP02649 317 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 ITGA4P13612 1032 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 YWHABP31946 246 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 SGO2Q562F6 1265 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 SH2D4BQ5SQS7 431 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 PLEKHH3Q7Z736 793 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 PASD1Q8IV76 773 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 HINFPQ9BQA5 517 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 SP110Q9HB58 689 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 E9PCH4 1651 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 NVLO15381 856 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 NTSR2O95665 410 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 SLFN14P0C7P3 912 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 EHHADHQ08426 723 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 PLA2G12BQ9BX93 195 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 A0A087WWV3 80 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 POTECB2RU33 542 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 ATP11AP98196 1134 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-204ENST00000538708 SDE2Q6IQ49 451 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms