RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 HIPK4Q8NE63 616 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 CALML6Q8TD86 181 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 LPPQ93052 612 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 GBP4Q96PP9 640 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 TTPALQ9BTX7 342 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 WDR26Q9H7D7 661 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 SCDO00767 359 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 MIEF2Q96C03 454 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 ASB1Q9Y576 335 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 FOXN1O15353 648 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 FOXP2O15409 715 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 CRTAMO95727 393 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 APPP05067 770 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 KRT4P19013 534 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 PDPK1O15530 556 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 SCNN1GP51170 649 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 ADAM15Q13444 863 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 MTERF2Q49AM1 385 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 Q6ZPA2 131 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 MAN2A2P49641 1150 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 ADCY7P51828 1080 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 SLC25A3Q00325 362 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 TM4SF20Q53R12 229 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 Q6ZRM9 215 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 RASSF10A6NK89 507 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 SDHAP31040 664 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 RASGRF1Q13972 1273 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 PTGS2P35354 604 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 STAT3P40763 770 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 FSTL1Q12841 308 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 DLG3Q92796 817 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 EXOC2Q96KP1 924 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ITGA4-211ENST00000490435 TRAF5O00463 557 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 HIP1RO75146 1068 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 RPS6KA4O75676 772 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 BMP5P22003 454 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 GAREM2Q75VX8 874 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 PCSK5Q92824 1860 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 SLC12A8A0AV02 714 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 EFCAB14O75071 495 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 COL10A1Q03692 680 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 ACAP1Q15027 740 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 HAS1Q92839 578 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 GPR87Q9BY21 358 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 XDHP47989 1333 aa6.62□□□□□ -1.35
ITGA4-211ENST00000490435 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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