RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488576.5

FAM107B-222, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-222	ENST00000488576	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		3.44	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		3.44	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		3.44	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		3.44	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	ABHD16A	O95870	558 aa		3.43	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	AMY2A	P04746	511 aa		3.43	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	AMY2B	P19961	511 aa		3.43	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	RABGGTB	P53611	331 aa		3.43	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	HERVK_113	P62684	666 aa		3.43	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	ST5	P78524	1137 aa		3.43	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	ACAP1	Q15027	740 aa		3.43	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		3.43	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		3.43	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		3.43	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		3.43	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		3.43	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		3.43	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	FZD1	Q9UP38	647 aa		3.43	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	ASXL2	Q76L83	1435 aa		3.43	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	KIAA0355	O15063	1070 aa		3.42	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	ITGB1	P05556	798 aa		3.42	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	FGFR1	P11362	822 aa		3.42	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	KRT15	P19012	456 aa		3.42	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	NR4A1	P22736	598 aa		3.42	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	ADCY7	P51828	1080 aa		3.42	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	PAK1	Q13153	545 aa		3.42	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		3.42	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		3.42	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	LPP	Q93052	612 aa		3.42	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	OSBP2	Q969R2	916 aa		3.42	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	PGBD4	Q96DM1	585 aa		3.42	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		3.42	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	TOR3A	Q9H497	397 aa		3.42	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		3.42	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		3.42	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	COL4A3	Q01955	1670 aa		3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	KCNK3	O14649	394 aa		3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	B3GALT2	O43825	422 aa		3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	MME	P08473	750 aa		3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	JAM2	P57087	298 aa		3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	NSMF	Q6X4W1	530 aa		3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	OSTM1	Q86WC4	334 aa		3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	FBXW5	Q969U6	566 aa		3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	SGSM3	Q96HU1	749 aa		3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	GPHA2	Q96T91	129 aa		3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	MNT	Q99583	582 aa		3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	TINF2	Q9BSI4	451 aa		3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	VWA7	Q9Y334	891 aa		3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	COX11	Q9Y6N1	276 aa		3.41	□□□□□ -1.86
FAM107B-222	ENST00000488576	UBE2QL1	A1L167	161 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	WNT9A	O14904	365 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	PPFIA4	O75335	1185 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	PYGM	P11217	842 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	ETFB	P38117	255 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	BPIFB4	P59827	614 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	ADAM8	P78325	824 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	HTR3D	Q70Z44	454 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	DPH6	Q7L8W6	267 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	MB21D1	Q8N884	522 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	TCF25	Q9BQ70	676 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	CBLC	Q9ULV8	474 aa		3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		3.39	□□□□□ -1.87
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		3.39	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms