RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ERVK-21P61565 698 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 GRB10Q13322 594 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 KRT40Q6A162 431 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 METTL13Q8N6R0 699 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 LINC01599Q8WXQ3 324 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 C17orf80Q9BSJ5 609 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 FTHL17Q9BXU8 183 aa8.63□□□□□ -1.03
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SGMS1-201ENST00000361543 GINS2Q9Y248 185 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa8.63□□□□□ -1.03
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SGMS1-201ENST00000361543 FAM205CA6NFA0 338 aa8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 ENPP3O14638 875 aa8.62□□□□□ -1.03
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SGMS1-201ENST00000361543 ST3GAL1Q11201 340 aa8.62□□□□□ -1.03
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SGMS1-201ENST00000361543 TRIM29Q14134 588 aa8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 KIZQ2M2Z5 673 aa8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM266Q2M3C6 531 aa8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
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SGMS1-201ENST00000361543 B3GNT9Q6UX72 402 aa8.62□□□□□ -1.03
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SGMS1-201ENST00000361543 BANK1Q8NDB2 785 aa8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 TNFRSF25Q93038 417 aa8.62□□□□□ -1.03
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SGMS1-201ENST00000361543 FAM20AQ96MK3 541 aa8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 SAMD11Q96NU1 681 aa8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 MAP7D2Q96T17 732 aa8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R16BQ96T49 567 aa8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 OSMRQ99650 979 aa8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 SUGCTQ9HAC7 445 aa8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 KCNMB3Q9NPA1 279 aa8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 NRBP2Q9NSY0 501 aa8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 WDR70Q9NW82 654 aa8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 VAV3Q9UKW4 847 aa8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 AKT3Q9Y243 479 aa8.62□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 TBX3O15119 743 aa8.61□□□□□ -1.03
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SGMS1-201ENST00000361543 TMOD1P28289 359 aa8.61□□□□□ -1.03
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SGMS1-201ENST00000361543 EPC2Q52LR7 807 aa8.61□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 XKR3Q5GH77 459 aa8.61□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 EFCAB12Q6NXP0 572 aa8.61□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC83Q8IWF9 413 aa8.61□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
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SGMS1-201ENST00000361543 LINC01465Q8N7H1 131 aa8.61□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.61□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 KIF2CQ99661 725 aa8.61□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 TMX1Q9H3N1 280 aa8.61□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.61□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 ERVK-5Q9HDB9 667 aa8.61□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 LMCD1Q9NZU5 365 aa8.61□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 KIF3AQ9Y496 699 aa8.61□□□□□ -1.03
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SGMS1-201ENST00000361543 DENND3A2RUS2 1198 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM150BA6NC51 233 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 BTBD18B2RXH4 712 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 EML1O00423 815 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 GPR182O15218 404 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 MARCH6O60337 910 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 MGEA5O60502 916 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 GPR32O75388 356 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 DGKIO75912 1065 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 STAG3L1P0CL83 205 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 CTNNB1P35222 781 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 PSMC5P62195 406 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 ODR4Q5SWX8 454 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
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