RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
VSTM4-201ENST00000298454 PSAPP07602 524 aa25.01■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 PLS3P13797 630 aa25.01■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 TSC1Q92574 1164 aa25.01■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 NDUFA10O95299 355 aa25.01■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 ICAM3P32942 547 aa25.01■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 ABHD15Q6UXT9 468 aa25.01■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 ILDR2Q71H61 639 aa25.01■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 CYFIP1Q7L576 1253 aa25.01■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 NEK11Q8NG66 645 aa25.01■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 DOCK5Q9H7D0 1870 aa25.01■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 STBD1O95210 358 aa25■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 EPB41P11171 864 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 OSBPP22059 807 aa25■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 FAM133AQ8N9E0 248 aa25■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 ATP6V0A1Q93050 837 aa25■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 SLC10A4Q96EP9 437 aa25■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 GBP3Q9H0R5 595 aa25■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa25■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa25■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 GNG11P61952 73 aa25■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 SLC25A27O95847 323 aa24.99■■□□□ 1.59
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VSTM4-201ENST00000298454 EDNRBP24530 442 aa24.99■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 APBA1Q02410 837 aa24.99■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 NFIL3Q16649 462 aa24.99■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 FAM102BQ5T8I3 360 aa24.99■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.99■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 BAP1Q92560 729 aa24.99■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 DRC1Q96MC2 740 aa24.99■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 WDR24Q96S15 920 aa24.99■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 PLAGL2Q9UPG8 496 aa24.99■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 MYH11P35749 1972 aa24.99■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC53A6NM62 1247 aa24.98■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 NOL4O94818 638 aa24.98■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 ABL1P00519 1130 aa24.98■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 PGK2P07205 417 aa24.98■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 SNAPC2Q13487 334 aa24.98■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 RRAGAQ7L523 313 aa24.98■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 OTUD6AQ7L8S5 288 aa24.98■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 SYCP3Q8IZU3 236 aa24.98■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 CEP170P1Q96L14 293 aa24.98■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 TIPINQ9BVW5 301 aa24.98■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
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VSTM4-201ENST00000298454 AFPP02771 609 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 MAPTP10636 758 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 PEX3P56589 373 aa24.98■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa24.98■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 GPIHBP1Q8IV16 184 aa24.98■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 BORCS6Q96GS4 357 aa24.98■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 DYNC1I1O14576 645 aa24.97■■□□□ 1.59
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VSTM4-201ENST00000298454 CYP2J2P51589 502 aa24.97■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 TCERG1LQ5VWI1 586 aa24.97■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa24.97■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa24.97■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 PRKCEQ02156 737 aa24.97■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 EEPD1Q7L9B9 569 aa24.97■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 FAM186BQ8IYM0 893 aa24.97■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 NLRC4Q9NPP4 1024 aa24.97■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 DMAC2Q9NW81 257 aa24.97■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 CYP2C8P10632 490 aa24.96■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 CDK17Q00537 523 aa24.96■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 SLC35C1Q96A29 364 aa24.96■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa24.96■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 SLC16A4O15374 487 aa24.95■■□□□ 1.59
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VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP25P42331 645 aa24.95■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 SOX10P56693 466 aa24.95■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 PPP2R3AQ06190 1150 aa24.95■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 HAUS6Q7Z4H7 955 aa24.95■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 EDEM3Q9BZQ6 932 aa24.95■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 CEP72Q9P209 647 aa24.95■■□□□ 1.59
VSTM4-201ENST00000298454 TISP43B9A030 160 aa24.95■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 ALCAMQ13740 583 aa24.95■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa24.95■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 PDXDC1Q6P996 788 aa24.95■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 FGD4Q96M96 766 aa24.95■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM206Q9H813 350 aa24.95■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa24.95■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa24.94■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 ATG7O95352 703 aa24.94■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 NCKAP1LP55160 1127 aa24.94■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 GTF2BQ00403 316 aa24.94■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 WDR78Q5VTH9 848 aa24.94■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA5Q8TBA6 731 aa24.94■■□□□ 1.58
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