RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272133.3

CNIH3-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH3, Length 2,558 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-201ENST00000272133 USP17L11C9JVI0 530 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 USP17L18D6R9N7 530 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 USP17L22D6RA61 530 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 USP17L19D6RCP7 530 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 USP17L20D6RJB6 530 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 AKR1B1P15121 316 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 USP17L24Q0WX57 530 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.31■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.3■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 CHN1P15882 459 aa20.3■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 GIT2Q14161 759 aa20.3■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 PPP1R18Q6NYC8 613 aa20.3■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 GLG1Q92896 1179 aa20.3■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 SLC35C1Q96A29 364 aa20.3■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 REEP2Q9BRK0 252 aa20.3■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.3■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.3■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 SMIM23A6NLE4 172 aa20.3■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 ABCB4P21439 1286 aa20.3■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF543Q08ER8 600 aa20.3■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.3■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.3■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 OLIG1Q8TAK6 271 aa20.3■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 SLC35G2Q8TBE7 412 aa20.3■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 SELENOSQ9BQE4 189 aa20.3■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 KDM4CQ9H3R0 1056 aa20.3■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 USP17L10C9JJH3 530 aa20.29■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 MMEP08473 750 aa20.29■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 PTENP60484 403 aa20.29■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 DR1Q01658 176 aa20.29■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 RAB17Q9H0T7 212 aa20.29■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa20.29■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 SUFUQ9UMX1 484 aa20.29■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.29■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 CLIC2O15247 247 aa20.29■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 EVI5O60447 810 aa20.29■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 TRIM37O94972 964 aa20.29■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 KCNA1Q09470 495 aa20.29■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.29■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.29■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 DONSONQ9NYP3 566 aa20.29■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 ASTN1O14525 1302 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 TLDC2A0PJX2 215 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 NR3C1P04150 777 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 RSPH10BP0C881 870 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 NPEPPSP55786 919 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 PICALMQ13492 652 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 DUPD1Q68J44 220 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 KCTD1Q719H9 257 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 HOOK3Q86VS8 718 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 CCDC50Q8IVM0 306 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 CCDC197Q8NCU1 140 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 INTUQ9ULD6 942 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 PPIP5K2O43314 1243 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 MGRN1O60291 552 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 GHRP10912 638 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 ANXA13P27216 316 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 PLTPP55058 493 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 P3H4Q92791 437 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 ERP44Q9BS26 406 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 ADAM7Q9H2U9 754 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.28■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 CCT8L1PA6NM43 557 aa20.27■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 MSL1Q68DK7 614 aa20.27■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 MTFR1LQ9H019 292 aa20.27■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 NARFQ9UHQ1 456 aa20.27■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa20.27■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 ATP8B3O60423 1300 aa20.27■□□□□ 0.84
CNIH3-201ENST00000272133 PDXKO00764 312 aa20.27■□□□□ 0.83
CNIH3-201ENST00000272133 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
CNIH3-201ENST00000272133 FERP16591 822 aa20.27■□□□□ 0.83
CNIH3-201ENST00000272133 PMS2P54278 862 aa20.27■□□□□ 0.83
CNIH3-201ENST00000272133 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
CNIH3-201ENST00000272133 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
CNIH3-201ENST00000272133 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.27■□□□□ 0.83
CNIH3-201ENST00000272133 FBXO25Q8TCJ0 367 aa20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms