RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636350.1

CACNB4-222, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 7,654 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-222	ENST00000636350	KRT71	Q3SY84	523 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	HYI	Q5T013	277 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	SPATA21	Q7Z572	469 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	IQCK	Q8N0W5	287 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	SERPINI1	Q99574	410 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TNS2	Q63HR2	1409 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CDH16	O75309	829 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	GGCX	P38435	758 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	STIL	Q15468	1287 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	VSIG1	Q86XK7	387 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	BTBD9	Q96Q07	612 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	KIF1A	Q12756	1690 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	KLF11	O14901	512 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	DNAJB5	O75953	348 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	GRIK3	Q13003	919 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	NDUFA5	Q16718	116 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PEX26	Q7Z412	305 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	SKAP1	Q86WV1	359 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	OGFOD1	Q8N543	542 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	SPATA5	Q8NB90	893 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	DCAF4	Q8WV16	495 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	RAD54L	Q92698	747 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	UIMC1	Q96RL1	719 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	MMS19	Q96T76	1030 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TRIM15	Q9C019	465 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ABCF2	Q9UG63	623 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350		H3BQF6	201 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ATP9B	O43861	1147 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TNFAIP3	P21580	790 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	MFAP3	P55082	362 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	MAPK6	Q16659	721 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ZNF653	Q96CK0	615 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CSRNP1	Q96S65	589 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	WWP1	Q9H0M0	922 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TOMM22	Q9NS69	142 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CLIC4	Q9Y696	253 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350		B4DLN1	442 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350		I3L4J1	428 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TM9SF1	O15321	606 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	EXOC3	O60645	756 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	C7	P10643	843 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PTPN7	P35236	360 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	RGS2	P41220	211 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	MMP13	P45452	471 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PMS2	P54278	862 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CASP7	P55210	303 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PNOC	Q13519	176 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CCDC14	Q49A88	953 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	DAAM2	Q86T65	1068 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	KCNN1	Q92952	543 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	FAM227B	Q96M60	508 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		3.56	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 136.5 ms