RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617958.4

CPEB1-215, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,776 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB1-215	ENST00000617958	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CPEB1-215	ENST00000617958	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CPEB1-215	ENST00000617958	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CPEB1-215	ENST00000617958		A8MUI8	341 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CPEB1-215	ENST00000617958	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CPEB1-215	ENST00000617958	BUB1	O43683	1085 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CPEB1-215	ENST00000617958	UNC5C	O95185	931 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CPEB1-215	ENST00000617958	PDE6B	P35913	854 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CPEB1-215	ENST00000617958	TUB	P50607	506 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CPEB1-215	ENST00000617958	ACVR2B	Q13705	512 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CPEB1-215	ENST00000617958	PPP2R5E	Q16537	467 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CPEB1-215	ENST00000617958	VWA3B	Q502W6	1294 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CPEB1-215	ENST00000617958	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CPEB1-215	ENST00000617958	RNF43	Q68DV7	783 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CPEB1-215	ENST00000617958	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	11.65	□□□□□ -0.54	3e-7	■□□□□ 9.7
CPEB1-215	ENST00000617958	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CPEB1-215	ENST00000617958	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CPEB1-215	ENST00000617958	SCOC	Q9UIL1	159 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CPEB1-215	ENST00000617958	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CPEB1-215	ENST00000617958	TAF1	P21675	1872 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	MYH1	P12882	1939 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	LRRC53	A6NM62	1247 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	PEX11A	O75192	247 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	STAT6	P42226	847 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	RPS6KA1	Q15418	735 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	DISC1	Q9NRI5	854 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	SERPING1	P05155	500 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	RFC4	P35249	363 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	FANCB	Q8NB91	859 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ANKS1A	Q92625	1134 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	INPP5D	Q92835	1189 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	MKL1	Q969V6	931 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ABCD1	P33897	745 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	FLT3	P36888	993 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	RAD23B	P54727	409 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	MYBPC3	Q14896	1274 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	WTAP	Q15007	396 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	SETDB1	Q15047	1291 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	MAN2A1	Q16706	1144 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ARMC3	Q5W041	872 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	NEK9	Q8TD19	979 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	FMO2	Q99518	471 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	PDP2	Q9P2J9	529 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM205C	A6NFA0	338 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	MAP3K13	O43283	966 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	FTCD	O95954	541 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	CD151	P48509	253 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	EHHADH	Q08426	723 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	CNGA2	Q16280	664 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	RRAGA	Q7L523	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	PTPRN2	Q92932	1015 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	RTL9	Q8NET4	1388 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	DAPK3	O43293	454 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ZPR1	O75312	459 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	NTSR2	O95665	410 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF174	Q15697	407 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	PKN1	Q16512	942 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC18A3	Q16572	532 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	MFSD5	Q6N075	450 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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