RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	TBK1	Q9UHD2	729 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	PDIA5	Q14554	519 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC16A4	O15374	487 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	PPFIA4	O75335	1185 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	IFNB1	P01574	187 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC38	Q502W7	563 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	KIF1A	Q12756	1690 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM150B	A6NC51	233 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	TMOD1	P28289	359 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	PPM1E	Q8WY54	764 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	AKAP3	O75969	853 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	SHMT1	P34896	483 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	SRL	Q86TD4	932 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	KIF4A	O95239	1232 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	POTEJ	P0CG39	1038 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	GALC	P54803	685 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	DDR1	Q08345	913 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	DENND2C	Q68D51	928 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	LRRC31	Q6UY01	552 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	PASD1	Q8IV76	773 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF653	Q96CK0	615 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	IQCD	Q96DY2	449 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM84A	Q96KN4	292 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	EVI5	O60447	810 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	NPR1	P16066	1061 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	TM4SF1	P30408	202 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	PROM2	Q8N271	834 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	HAS1	Q92839	578 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	LXN	Q9BS40	222 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	TLR10	Q9BXR5	811 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	GGT7	Q9UJ14	662 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	USP54	Q70EL1	1684 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	MYH10	P35580	1976 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	FER	P16591	822 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	MTM1	Q13496	603 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	EMB	Q6PCB8	327 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	GLG1	Q92896	1179 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	USP20	Q9Y2K6	914 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	TISP43	B9A030	160 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	ACSL3	O95573	720 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	ITGA4	P13612	1032 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	SMTN	P53814	917 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	VPS72	Q15906	364 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	CREG2	Q8IUH2	290 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	JDP2	Q8WYK2	163 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	SYNC	Q9H7C4	482 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		13.83	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	MSH4	O15457	936 aa		13.83	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF394	Q53GI3	561 aa		13.83	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		13.83	□□□□□ -0.19

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