RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 RPS6KA5O75582 802 aa20.04■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.04■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 FGFR1P11362 822 aa20.04■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 STAT5BP51692 787 aa20.04■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.04■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.04■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.04■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 MAP3K14Q99558 947 aa20.04■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 SDF4Q9BRK5 362 aa20.04■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 S1PR5Q9H228 398 aa20.04■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.04■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 KCNH7Q9NS40 1196 aa20.04■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 EVPLQ92817 2033 aa20.03■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 FSD2A1L4K1 749 aa20.03■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.03■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.03■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 NME8Q8N427 588 aa20.03■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.03■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 PGBD1Q96JS3 809 aa20.03■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 TCF25Q9BQ70 676 aa20.03■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.03■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 RGS18Q9NS28 235 aa20.03■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 HIDE1A8MVS5 230 aa20.02■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 MAFGO15525 162 aa20.02■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 ARP10275 920 aa20.02■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 KLRC1P26715 233 aa20.02■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 SMARCA1P28370 1054 aa20.02■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 CASC1Q6TDU7 716 aa20.02■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20.02■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.02■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.02■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.02■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 RIPOR3Q96MK2 946 aa20.02■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.02■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa20.02■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 CWH43Q9H720 699 aa20.02■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 C1orf112Q9NSG2 853 aa20.02■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa20.02■□□□□ 0.8
CCDC40-211ENST00000574099 CACNA1HO95180 2353 aa20.01■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 C9IYK1 514 aa20.01■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 LAG3P18627 525 aa20.01■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 PDE4AP27815 886 aa20.01■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 PBX3P40426 434 aa20.01■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 GNAQP50148 359 aa20.01■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 KCNC3Q14003 757 aa20.01■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 TTC22Q5TAA0 569 aa20.01■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.01■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 SMOC2Q9H3U7 446 aa20.01■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.01■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 NFASCO94856 1347 aa20.01■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC69A6NI79 296 aa20■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 BACH1O14867 736 aa20■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 PRC1O43663 620 aa20■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 KIZQ2M2Z5 673 aa20■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa20■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 ASCL5Q7RTU5 278 aa20■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa20■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 OSMRQ99650 979 aa20■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 MYO15AQ9UKN7 3530 aa20■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 GPR182O15218 404 aa19.99■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 CHMLP26374 656 aa19.99■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 AAMPQ13685 434 aa19.99■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 FAM228AQ86W67 206 aa19.99■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM161AQ9NX61 479 aa19.99■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 LZTS1Q9Y250 596 aa19.99■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 NR2E1Q9Y466 385 aa19.99■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 C2CD4DB7Z1M9 353 aa19.98■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 HBP1O60381 514 aa19.98■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 BRD1O95696 1058 aa19.98■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 PLCB3Q01970 1234 aa19.98■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 MTMR3Q13615 1198 aa19.98■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 ODR4Q5SWX8 454 aa19.98■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM105Q8N8V8 129 aa19.98■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 RASGRP4Q8TDF6 673 aa19.98■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 POMKQ9H5K3 350 aa19.98■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 CCNE2O96020 404 aa19.97■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 VTNP04004 478 aa19.97■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 CA8P35219 290 aa19.97■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 SLC26A2P50443 739 aa19.97■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 FAM160B1Q5W0V3 765 aa19.97■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 KCNT2Q6UVM3 1135 aa19.97■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 LRRC55Q6ZSA7 311 aa19.97■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 TMC7Q7Z402 723 aa19.97■□□□□ 0.79
CCDC40-211ENST00000574099 SORCS3Q9UPU3 1222 aa19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms