RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566047.5

CMC2-215, Transcript of C-X9-C motif containing 2, human

TSL 2

Gene CMC2, Length 660 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CMC2-215	ENST00000566047	DLG3	Q92796	817 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	OR10A5	Q9H207	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	NR2E1	Q9Y466	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	FOXP2	O15409	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	ARHGAP6	O43182	974 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	FSHB	P01225	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	CR2	P20023	1033 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	SDHA	P31040	664 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	DUSP8	Q13202	625 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	AGBL4	Q5VU57	503 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	CFHR4	Q92496	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	VPS11	Q9H270	941 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	SLC12A8	A0AV02	714 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	CDC14B	O60729	498 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	RAD17	O75943	681 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	APP	P05067	770 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	COMT	P21964	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047		Q9UFV3	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	SRRD	Q9UH36	339 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	ASB1	Q9Y576	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	HIP1R	O75146	1068 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	NPTXR	O95502	500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	AMH	P03971	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	IRF9	Q00978	393 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	MOGS	Q13724	837 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	WDR48	Q8TAF3	677 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	EDA	Q92838	391 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	PLD2	O14939	933 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	ACVRL1	P37023	503 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	MRE11	P49959	708 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	STAT5B	P51692	787 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047		Q6ZSN1	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	USP30	Q70CQ3	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	BOC	Q9BWV1	1114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	GDF5	P43026	501 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	MEOX1	P50221	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	HGFAC	Q04756	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	CALML6	Q8TD86	181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047		M0R2C6	588 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	FZD7	O75084	574 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	SLPI	P03973	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CMC2-215	ENST00000566047	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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