RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541295.5

LMO3-225, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-225ENST00000541295 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 PREBQ9HCU5 417 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 PARP2Q9UGN5 583 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 HEG1Q9ULI3 1381 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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LMO3-225ENST00000541295 STRNO43815 780 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 ADCY5O95622 1261 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 CYP17A1P05093 508 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 ETFBP38117 255 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 ATP5OP48047 213 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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