RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	GPRASP2	Q96D09	838 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	KRT23	Q9C075	422 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	RGS18	Q9NS28	235 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	LAMA4	Q16363	1823 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	PDE4A	P27815	886 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	CLCN5	P51795	746 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	KRT76	Q01546	638 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	CASD1	Q96PB1	797 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	LZTS1	Q9Y250	596 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-222	ENST00000533557	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	PIK3CD	O00329	1044 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	DSC3	Q14574	896 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	FLCN	Q8NFG4	579 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	LNPK	Q9C0E8	428 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	NR2E1	Q9Y466	385 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	KLRC1	P26715	233 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	UBE2S	Q16763	222 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	FAM228A	Q86W67	206 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	JADE2	Q9NQC1	790 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	SPTBN2	O15020	2390 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	RPS6KA5	O75582	802 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	LAG3	P18627	525 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	AOC1	P19801	751 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	TRAF1	Q13077	416 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	MTMR1	Q13613	665 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	ANGPT1	Q15389	498 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	MCTP2	Q6DN12	878 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	NME8	Q8N427	588 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	CASP10	Q92851	521 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	MYL10	Q9BUA6	226 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	FSD2	A1L4K1	749 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	DENND3	A2RUS2	1198 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557		M0QZ92	97 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	EPCAM	P16422	314 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	ATP4A	P20648	1035 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	STAT5B	P51692	787 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	ANTXR2	P58335	489 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	ACTR2	P61160	394 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	ITIH3	Q06033	890 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	GPR32	O75388	356 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	ATG7	O95352	703 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	CCNE2	O96020	404 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	CES5A	Q6NT32	575 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18

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