RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533507.5

NDUFS3-211, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 2

Gene NDUFS3, Length 1,769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-211ENST00000533507 TRPC6Q9Y210 931 aa29.47■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 HTTP42858 3142 aa29.47■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 A6NJR5 290 aa29.47■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 PGK1P00558 417 aa29.47■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 MYCP01106 439 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 CCDC192P0DO97 292 aa29.47■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 ARSHQ5FYA8 562 aa29.47■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 USO1O60763 962 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 MYL3P08590 195 aa29.46■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa29.46■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa29.46■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 TUBE1Q9UJT0 475 aa29.46■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 STBD1O95210 358 aa29.45■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 LRSAM1Q6UWE0 723 aa29.45■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 FAM167AQ96KS9 214 aa29.45■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 GSDMAQ96QA5 445 aa29.45■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 CYP26B1Q9NR63 512 aa29.45■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 MAN1B1Q9UKM7 699 aa29.45■■■□□ 2.31
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC26A2P50443 739 aa29.44■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 TYRO3Q06418 890 aa29.44■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 PLCB4Q15147 1175 aa29.44■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa29.44■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 GNASQ5JWF2 1037 aa29.44■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa29.44■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 H3BRB1 525 aa29.44■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 SARSP49591 514 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF445P59923 1031 aa29.44■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 KMT5BQ4FZB7 885 aa29.44■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 C1orf186Q6ZWK4 172 aa29.44■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 C16orf70Q9BSU1 422 aa29.44■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 RNPEPQ9H4A4 650 aa29.44■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 EXOC1Q9NV70 894 aa29.44■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 RMND1Q9NWS8 449 aa29.44■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 NT5DC1Q5TFE4 455 aa29.43■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 ATP8B4Q8TF62 1192 aa29.43■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 REEP2Q9BRK0 252 aa29.43■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 PANK4Q9NVE7 773 aa29.43■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 MYADML2A6NDP7 307 aa29.42■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 GJA9P57773 515 aa29.42■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 GIT2Q14161 759 aa29.42■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 SPATA20Q8TB22 786 aa29.42■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 DNAJC19Q96DA6 116 aa29.42■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa29.42■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 TBCAO75347 108 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 UNC13DQ70J99 1090 aa29.41■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 CCDC65Q8IXS2 484 aa29.41■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 KCND2Q9NZV8 630 aa29.41■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 SFI1A8K8P3 1242 aa29.41■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 KLRC4O43908 158 aa29.41■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 STX1AQ16623 288 aa29.41■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 TSPY26PQ9H489 355 aa29.41■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 NLRP12P59046 1061 aa29.4■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 IGBP1P78318 339 aa29.4■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 ANO10Q9NW15 660 aa29.4■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa29.39■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 RSPH10B2B2RC85 870 aa29.39■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 ZEB2O60315 1214 aa29.39■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 HBP1O60381 514 aa29.39■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 FAM13AO94988 1023 aa29.39■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 RSPH10BP0C881 870 aa29.39■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 FAM102BQ5T8I3 360 aa29.39■■■□□ 2.3
NDUFS3-211ENST00000533507 DGAT1O75907 488 aa29.39■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 CNNM4Q6P4Q7 775 aa29.39■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 HPS3Q969F9 1004 aa29.39■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 FUCA2Q9BTY2 467 aa29.39■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 TBC1D7Q9P0N9 293 aa29.39■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 MSCO60682 206 aa29.38■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 HIP1RO75146 1068 aa29.38■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 MORC3Q14149 939 aa29.38■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 KCNB1Q14721 858 aa29.38■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 ANO6Q4KMQ2 910 aa29.38■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 TRIML1Q8N9V2 468 aa29.38■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC7A3Q8WY07 619 aa29.38■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 GUCY2CP25092 1073 aa29.37■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa29.37■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 COASYQ13057 564 aa29.37■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 KIAA0753Q2KHM9 967 aa29.37■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 DPCR1Q3MIW9 517 aa29.37■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 MYCT1Q8N699 235 aa29.37■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa29.37■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa29.37■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 DNAJC25Q9H1X3 360 aa29.37■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa29.37■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 ADAMTS4O75173 837 aa29.36■■■□□ 2.29
NDUFS3-211ENST00000533507 RHOBTB3O94955 611 aa29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms