RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531473.5

TSTA3-214, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSTA3, Length 2,220 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-214ENST00000531473 PSMA7O14818 248 aa22.23■■□□□ 1.15
TSTA3-214ENST00000531473 ATP9AO75110 1047 aa22.23■■□□□ 1.15
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TSTA3-214ENST00000531473 ASIC1P78348 528 aa22.23■■□□□ 1.15
TSTA3-214ENST00000531473 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TSTA3-214ENST00000531473 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.23■■□□□ 1.15
TSTA3-214ENST00000531473 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TSTA3-214ENST00000531473 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.23■■□□□ 1.15
TSTA3-214ENST00000531473 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.23■■□□□ 1.15
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TSTA3-214ENST00000531473 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
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TSTA3-214ENST00000531473 CST9Q5W186 159 aa22.22■■□□□ 1.15
TSTA3-214ENST00000531473 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.22■■□□□ 1.15
TSTA3-214ENST00000531473 SV2BQ7L1I2 683 aa22.22■■□□□ 1.15
TSTA3-214ENST00000531473 TMTC1Q8IUR5 882 aa22.22■■□□□ 1.15
TSTA3-214ENST00000531473 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TSTA3-214ENST00000531473 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.22■■□□□ 1.15
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TSTA3-214ENST00000531473 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.22■■□□□ 1.15
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TSTA3-214ENST00000531473 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.22■■□□□ 1.15
TSTA3-214ENST00000531473 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.22■■□□□ 1.15
TSTA3-214ENST00000531473 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.22■■□□□ 1.15
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TSTA3-214ENST00000531473 GAS7O60861 476 aa22.21■■□□□ 1.15
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TSTA3-214ENST00000531473 TRIM47Q96LD4 638 aa22.21■■□□□ 1.15
TSTA3-214ENST00000531473 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
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TSTA3-214ENST00000531473 MYPNQ86TC9 1320 aa22.21■■□□□ 1.15
TSTA3-214ENST00000531473 RGS20O76081 388 aa22.21■■□□□ 1.15
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TSTA3-214ENST00000531473 HYIQ5T013 277 aa22.21■■□□□ 1.15
TSTA3-214ENST00000531473 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.21■■□□□ 1.15
TSTA3-214ENST00000531473 DDX12PQ92771 950 aa22.21■■□□□ 1.15
TSTA3-214ENST00000531473 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.21■■□□□ 1.15
TSTA3-214ENST00000531473 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.21■■□□□ 1.15
TSTA3-214ENST00000531473 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.21■■□□□ 1.15
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TSTA3-214ENST00000531473 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.145e-13■■■□□ 16.2
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TSTA3-214ENST00000531473 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.19■■□□□ 1.14
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TSTA3-214ENST00000531473 ERCC3P19447 782 aa22.18■■□□□ 1.14
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TSTA3-214ENST00000531473 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.18■■□□□ 1.14
TSTA3-214ENST00000531473 GPATCH11Q8N954 259 aa22.18■■□□□ 1.14
TSTA3-214ENST00000531473 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.18■■□□□ 1.14
TSTA3-214ENST00000531473 BANK1Q8NDB2 785 aa22.18■■□□□ 1.14
TSTA3-214ENST00000531473 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TSTA3-214ENST00000531473 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.18■■□□□ 1.14
TSTA3-214ENST00000531473 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.18■■□□□ 1.14
TSTA3-214ENST00000531473 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.18■■□□□ 1.14
TSTA3-214ENST00000531473 A0A0U1RQJ8 604 aa22.17■■□□□ 1.14
TSTA3-214ENST00000531473 LGALS16A8MUM7 142 aa22.17■■□□□ 1.14
TSTA3-214ENST00000531473 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
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