RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517488.1

PDGFRB-202, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene PDGFRB, Length 822 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-202ENST00000517488 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 TAP1Q03518 808 aa15.88■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 ADGRE1Q14246 886 aa15.88■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 SPRED2Q7Z698 418 aa15.88■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 MYOCDQ8IZQ8 938 aa15.88■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 NME8Q8N427 588 aa15.88■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 APBB2Q92870 758 aa15.88■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 C8orf76Q96K31 380 aa15.88■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 CERS4Q9HA82 394 aa15.88■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 NRBP2Q9NSY0 501 aa15.88■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 A0A0C4DFX4 3053 aa15.87■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 STBD1O95210 358 aa15.87■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 CD52P31358 61 aa15.87■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 PPP2R5CQ13362 524 aa15.87■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa15.87■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 METTL13Q8N6R0 699 aa15.87■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 TBC1D32Q96NH3 1257 aa15.87■□□□□ 0.13
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PDGFRB-202ENST00000517488 CDHR5Q9HBB8 845 aa15.87■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 CEP131Q9UPN4 1083 aa15.87■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa15.87■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 TMEM150BA6NC51 233 aa15.86■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 EPOPA6NHQ4 379 aa15.86■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 M0QZ92 97 aa15.86■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 TBX3O15119 743 aa15.86■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 ST18O60284 1047 aa15.86■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 MARCH6O60337 910 aa15.86■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 CLCN3P51790 818 aa15.86■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 BANK1Q8NDB2 785 aa15.86■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 PPP1R16BQ96T49 567 aa15.86■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 GINS2Q9Y248 185 aa15.86■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa15.86■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 MYO9BQ13459 2157 aa15.86■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 KAT6AQ92794 2004 aa15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 RFXAPO00287 272 aa15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 ENPP3O14638 875 aa15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 MAGEB2O15479 319 aa15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 UPP2O95045 317 aa15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 VTNP04004 478 aa15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 TMEM266Q2M3C6 531 aa15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 XKR3Q5GH77 459 aa15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 EFCAB12Q6NXP0 572 aa15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 LRRC71Q8N4P6 559 aa15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 LINC01465Q8N7H1 131 aa15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM184AQ8NB25 1140 aa15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 LINC01599Q8WXQ3 324 aa15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 TOP1MTQ969P6 601 aa15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 SH2D3AQ9BRG2 576 aa15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 PADI3Q9ULW8 664 aa15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 SQORQ9Y6N5 450 aa15.85■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 DDX11L8A8MPP1 907 aa15.84■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 ATP2B1P20020 1258 aa15.84■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 PSMC5P62195 406 aa15.84■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 SPIRE1Q08AE8 756 aa15.84■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 KIZQ2M2Z5 673 aa15.84■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 MTERF2Q49AM1 385 aa15.84■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 SLFN12Q8IYM2 578 aa15.84■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 USP38Q8NB14 1042 aa15.84■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 TMEM40Q8WWA1 233 aa15.84■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 ARNTL2Q8WYA1 636 aa15.84■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 TMX3Q96JJ7 454 aa15.84■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 CEP89Q96ST8 783 aa15.84■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 INSL6Q9Y581 213 aa15.84■□□□□ 0.13
PDGFRB-202ENST00000517488 LINC01553A4QN01 128 aa15.83■□□□□ 0.12
PDGFRB-202ENST00000517488 NEMFO60524 1076 aa15.83■□□□□ 0.12
PDGFRB-202ENST00000517488 GPR32O75388 356 aa15.83■□□□□ 0.12
PDGFRB-202ENST00000517488 BAG4O95429 457 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
PDGFRB-202ENST00000517488 IGFBP4P22692 258 aa15.83■□□□□ 0.12
PDGFRB-202ENST00000517488 QARSP47897 775 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
PDGFRB-202ENST00000517488 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa15.83■□□□□ 0.12
PDGFRB-202ENST00000517488 PAK2Q13177 524 aa15.83■□□□□ 0.12
PDGFRB-202ENST00000517488 EPHA7Q15375 998 aa15.83■□□□□ 0.12
PDGFRB-202ENST00000517488 CALCRLQ16602 461 aa15.83■□□□□ 0.12
PDGFRB-202ENST00000517488 PLA2G4FQ68DD2 849 aa15.83■□□□□ 0.12
PDGFRB-202ENST00000517488 NCAPH2Q6IBW4 605 aa15.83■□□□□ 0.12
PDGFRB-202ENST00000517488 ANO5Q75V66 913 aa15.83■□□□□ 0.12
PDGFRB-202ENST00000517488 SLC17A8Q8NDX2 589 aa15.83■□□□□ 0.12
PDGFRB-202ENST00000517488 MTMR9Q96QG7 549 aa15.83■□□□□ 0.12
PDGFRB-202ENST00000517488 OSMRQ99650 979 aa15.83■□□□□ 0.12
PDGFRB-202ENST00000517488 TMEM60Q9H2L4 133 aa15.83■□□□□ 0.12
PDGFRB-202ENST00000517488 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
PDGFRB-202ENST00000517488 TMX1Q9H3N1 280 aa15.83■□□□□ 0.12
PDGFRB-202ENST00000517488 SUGCTQ9HAC7 445 aa15.83■□□□□ 0.12
PDGFRB-202ENST00000517488 RGL1Q9NZL6 768 aa15.83■□□□□ 0.12
PDGFRB-202ENST00000517488 AKT3Q9Y243 479 aa15.83■□□□□ 0.12
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