RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.85■■□□□ 1.09
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SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM266Q2M3C6 531 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-220ENST00000511663 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-220ENST00000511663 PRR16Q569H4 304 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-220ENST00000511663 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa21.84■■□□□ 1.09
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SH3BP2-220ENST00000511663 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-220ENST00000511663 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-220ENST00000511663 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-220ENST00000511663 GPR37L1O60883 481 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-220ENST00000511663 CSPG5O95196 566 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-220ENST00000511663 MMP1P03956 469 aa21.83■■□□□ 1.09
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SH3BP2-220ENST00000511663 RPS6KB1P23443 525 aa21.83■■□□□ 1.09
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SH3BP2-220ENST00000511663 FAM122AQ96E09 287 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-220ENST00000511663 CD320Q9NPF0 282 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-220ENST00000511663 AAASQ9NRG9 546 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-220ENST00000511663 C1orf112Q9NSG2 853 aa21.83■■□□□ 1.09
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SH3BP2-220ENST00000511663 LINC00271P0C7V0 271 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 PKN1Q16512 942 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
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SH3BP2-220ENST00000511663 GABBR1Q9UBS5 961 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 TMOD1P28289 359 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 HYAL1Q12794 435 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 COL19A1Q14993 1142 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC24A5Q71RS6 500 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 CRIPAKQ8N1N5 446 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.08
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SH3BP2-220ENST00000511663 RGS18Q9NS28 235 aa21.81■■□□□ 1.08
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SH3BP2-220ENST00000511663 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa21.81■■□□□ 1.08
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SH3BP2-220ENST00000511663 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa21.8■■□□□ 1.08
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SH3BP2-220ENST00000511663 REV3LO60673 3130 aa21.79■■□□□ 1.08
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SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.79■■□□□ 1.08
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SH3BP2-220ENST00000511663 POF1BQ8WVV4 589 aa21.79■■□□□ 1.08
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SH3BP2-220ENST00000511663 EFCAB12Q6NXP0 572 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 ADHFE1Q8IWW8 467 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 DISC1Q9NRI5 854 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 AKT3Q9Y243 479 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-220ENST00000511663 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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