RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433909.2

CCDC189-201, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC189, Length 1,157 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-201ENST00000433909 ATP4AP20648 1035 aa22.12■■□□□ 1.13
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CCDC189-201ENST00000433909 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.12■■□□□ 1.13
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CCDC189-201ENST00000433909 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.11■■□□□ 1.13
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CCDC189-201ENST00000433909 COL19A1Q14993 1142 aa22.1■■□□□ 1.13
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CCDC189-201ENST00000433909 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.1■■□□□ 1.13
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CCDC189-201ENST00000433909 SAMM50Q9Y512 469 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 C22orf31O95567 290 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 MMP1P03956 469 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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CCDC189-201ENST00000433909 ODR4Q5SWX8 454 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 METTL13Q8N6R0 699 aa22.09■■□□□ 1.13
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CCDC189-201ENST00000433909 DENND3A2RUS2 1198 aa22.08■■□□□ 1.13
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CCDC189-201ENST00000433909 P2RX5Q93086 422 aa22.08■■□□□ 1.13
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CCDC189-201ENST00000433909 FAM50BQ9Y247 325 aa22.08■■□□□ 1.13
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CCDC189-201ENST00000433909 WDR64B1ANS9 1081 aa22.07■■□□□ 1.12
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CCDC189-201ENST00000433909 ITGB1P05556 798 aa22.07■■□□□ 1.12
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CCDC189-201ENST00000433909 EVCP57679 992 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 NLRP5P59047 1200 aa22.07■■□□□ 1.12
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CCDC189-201ENST00000433909 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.07■■□□□ 1.12
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CCDC189-201ENST00000433909 RUFY3Q7L099 469 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 FAM167AQ96KS9 214 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 ADAM2Q99965 735 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 IGFLR1Q9H665 355 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 MSH4O15457 936 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 DISC1Q9NRI5 854 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 RGS18Q9NS28 235 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 MAGEB2O15479 319 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 CHMP2AO43633 222 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 EDIL3O43854 480 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 GAS7O60861 476 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 DNAJB1P25685 340 aa22.05■■□□□ 1.12
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CCDC189-201ENST00000433909 LTBRP36941 435 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 USP11P51784 963 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 CLCN3P51790 818 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 CAMK1Q14012 370 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 CLUL1Q15846 466 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CCDC189-201ENST00000433909 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.05■■□□□ 1.12
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