RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 HAUS3Q68CZ6 603 aa17.23■□□□□ 0.35
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PGGT1B-202ENST00000379615 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC17A8Q8NDX2 589 aa17.23■□□□□ 0.35
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PGGT1B-202ENST00000379615 EFCAB14O75071 495 aa17.19■□□□□ 0.34
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PGGT1B-202ENST00000379615 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 XKR9Q5GH70 373 aa17.19■□□□□ 0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 C9orf50Q5SZB4 431 aa17.19■□□□□ 0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 CATSPER3Q86XQ3 398 aa17.19■□□□□ 0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 IGSF22Q8N9C0 903 aa17.19■□□□□ 0.34
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZBTB10Q96DT7 871 aa17.19■□□□□ 0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM161BQ96MY7 647 aa17.19■□□□□ 0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
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PGGT1B-202ENST00000379615 MAFO75444 373 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
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PGGT1B-202ENST00000379615 LRIT3Q3SXY7 679 aa17.18■□□□□ 0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 ODR4Q5SWX8 454 aa17.18■□□□□ 0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 PLA2G4FQ68DD2 849 aa17.18■□□□□ 0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 CNKSR3Q6P9H4 555 aa17.18■□□□□ 0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 OTOP2Q7RTS6 562 aa17.18■□□□□ 0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 SNX29Q8TEQ0 813 aa17.18■□□□□ 0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 AK8Q96MA6 479 aa17.18■□□□□ 0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 AKT3Q9Y243 479 aa17.18■□□□□ 0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa17.18■□□□□ 0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa17.17■□□□□ 0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 VWA3AA6NCI4 1184 aa17.17■□□□□ 0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBBXA8MT70 800 aa17.17■□□□□ 0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNA4P22459 653 aa17.17■□□□□ 0.34
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