RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332859.10

SUMO3-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMO3, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-201ENST00000332859 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 ASB14A6NK59 587 aa22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 N4BP3O15049 544 aa22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 TPM1P09493 284 aa22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 LRRC63Q05C16 580 aa22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 PADI6Q6TGC4 694 aa22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 TSG101Q99816 390 aa22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 PLXNB2O15031 1838 aa22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 SLC10A3P09131 477 aa22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 RSPH10BP0C881 870 aa22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 RARRES1P49788 294 aa22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 NEDD9Q14511 834 aa22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 CNGA4Q8IV77 575 aa22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.22■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 SP4Q02446 784 aa22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 PARVGQ9HBI0 331 aa22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-201ENST00000332859 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 ADORA2AP29274 412 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 RBL2Q08999 1139 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 SORBS3O60504 671 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 MFAP3LO75121 409 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 MAPK4P31152 587 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF131P52739 623 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 MYCT1Q8N699 235 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 TIPINQ9BVW5 301 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.141e-7■■■■□ 23.3
SUMO3-201ENST00000332859 ATG7O95352 703 aa22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 FECHP22830 423 aa22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 INHBEP58166 350 aa22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 GPR142Q7Z601 462 aa22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 BACH1O14867 736 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 HIP1RO75146 1068 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 XKR9Q5GH70 373 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 VPS16Q9H269 839 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 GGPS1O95749 300 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 METTL7BQ6UX53 244 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 CCDC102AQ96A19 550 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 A0A1W2PQC6 194 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 SFI1A8K8P3 1242 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 KIF3CO14782 793 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF862O60290 1169 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 GCNT3O95395 438 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 GYPCP04921 128 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 CASP5P51878 434 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 GRB14Q14449 540 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 ANO5Q75V66 913 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 ARMCX2Q7L311 632 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-201ENST00000332859 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms