RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556956.1

SLIRP-208, Transcript of SRA stem-loop interacting RNA binding protein, human

TSL 2

Gene SLIRP, Length 450 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLIRP-208	ENST00000556956	TMEM51	Q9NW97	253 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	AOX1	Q06278	1338 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ADGRB2	O60241	1585 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	RTL1	A6NKG5	1358 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ZFYVE9	O95405	1425 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ASXL2	Q76L83	1435 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	STX6	O43752	255 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	AMH	P03971	560 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CHML	P26374	656 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	L1CAM	P32004	1257 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	VIPR1	P32241	457 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	KCNJ4	P48050	445 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SEPHS1	P49903	392 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SLC20A2	Q08357	652 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TERF2	Q15554	542 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TEX35	Q5T0J7	233 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ZPBP2	Q6X784	338 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CABP7	Q86V35	215 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	AFAP1	Q8N556	730 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TSPYL6	Q8N831	410 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SPC24	Q8NBT2	197 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	KIF18A	Q8NI77	898 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	BRF1	Q92994	677 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ERO1A	Q96HE7	468 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	APBA2	Q99767	749 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	HAUS7	Q99871	368 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CAPN10	Q9HC96	672 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	STAP2	Q9UGK3	403 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CLTCL1	P53675	1640 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	USP32	Q8NFA0	1604 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	MYOM1	P52179	1685 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	RGS12	O14924	1447 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TSPOAP1	O95153	1857 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	DIP2B	Q9P265	1576 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956		A0A1W2PQH9	124 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956		H0Y8X5	98 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SHOX	O15266	292 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	RAB11FIP3	O75154	756 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	GNAI2	P04899	355 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	GNAI3	P08754	354 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TPM1	P09493	284 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PFKL	P17858	780 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SYT1	P21579	422 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PTGS1	P23219	599 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	HSPA4	P34932	840 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	IL13	P35225	146 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	IL12RB1	P42701	662 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ZNF75D	P51815	510 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ATP8B2	P98198	1209 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	AMPD2	Q01433	879 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	GRB10	Q13322	594 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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