RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, human

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMO3-222	ENST00000540445		M0QZ92	97 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	ADAMTS3	O15072	1205 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	ATG7	O95352	703 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	GHR	P10912	638 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	ERVK-21	P61565	698 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	GRB10	Q13322	594 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	PLCB4	Q15147	1175 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	IER5	Q5VY09	327 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	KRT40	Q6A162	431 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	RPAIN	Q86UA6	219 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	APBB2	Q92870	758 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	ZNF302	Q9NR11	478 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	SAMM50	Q9Y512	469 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	NID2	Q14112	1375 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	LINC01553	A4QN01	128 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	HBP1	O60381	514 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	DEXI	O95424	95 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	CCNE2	O96020	404 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	KLRC1	P26715	233 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	SLC26A2	P50443	739 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	USP11	P51784	963 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	MGAT3	Q09327	533 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	IL27	Q8NEV9	243 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	TOP1MT	Q969P6	601 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	YME1L1	Q96TA2	773 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	MYO7A	Q13402	2215 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	CDKL5	O76039	1030 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	PSAP	P07602	524 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	TBCK	Q8TEA7	893 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	GINS2	Q9Y248	185 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		10.21	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	TNFRSF10A	O00220	468 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	ENPP3	O14638	875 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	BMP1	P13497	986 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	XBP1	P17861	261 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	CIITA	P33076	1130 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	KRT76	Q01546	638 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	TFF2	Q03403	129 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	SCRN1	Q12765	414 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	LPIN1	Q14693	890 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	ANKRD1	Q15327	319 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	BLID	Q8IZY5	108 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	NME8	Q8N427	588 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	METTL13	Q8N6R0	699 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	IL17RA	Q96F46	866 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	AIFM3	Q96NN9	605 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	MSH4	O15457	936 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	CHMP2A	O43633	222 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	GAS7	O60861	476 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	CD52	P31358	61 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LMO3-222	ENST00000540445	ANAPC15	P60006	121 aa		10.19	□□□□□ -0.78

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