RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 CABP7Q86V35 215 aa9.97□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 STK11IPQ8N1F8 1099 aa9.97□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa9.97□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 COMMD10Q9Y6G5 202 aa9.97□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A1W2PQJ5 194 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 EFEMP2O95967 443 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 CD8BP10966 210 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 AGXTP21549 392 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 RASSF7Q02833 373 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 TOR2AQ5JU69 321 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 BICRALQ6AI39 1079 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 NME9Q86XW9 330 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 SVIPQ8NHG7 77 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 CLEC4DQ8WXI8 215 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 SEC14L1Q92503 715 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 ANO3Q9BYT9 981 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 NMRK2Q9NPI5 230 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 SIT1Q9Y3P8 196 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 GPR45Q9Y5Y3 372 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 CLEC2LP0C7M8 214 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 HSPA6P17066 643 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 MTNR1BP49286 362 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 GSK3AP49840 483 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 MANFP55145 182 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 ADCY1Q08828 1119 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 CT83Q5H943 113 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 WFDC3Q8IUB2 231 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 SPPL2CQ8IUH8 684 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 NETO2Q8NC67 525 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 PDZD8Q8NEN9 1154 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 SSH1Q8WYL5 1049 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 RUNDC1Q96C34 613 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 SARGQ9BW04 601 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 AP5M1Q9H0R1 490 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 SGSM2O43147 1006 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 DYRK3O43781 588 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 MMEP08473 750 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 C5AR1P21730 350 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 B3GNT9Q6UX72 402 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 SPRED2Q7Z698 418 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM48Q8IWZ4 208 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 C7orf31Q8N865 590 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 POFUT1Q9H488 388 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNG1Q9UIX4 513 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 PALD1Q9ULE6 856 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC5A6Q9Y289 635 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 TCRBV5S2A0A599 114 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 FITM1A5D6W6 292 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 ACOT7O00154 380 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 OSMP13725 252 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 AKAP5P24588 427 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 CYP4F8P98187 520 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNMA1Q12791 1236 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 UGT8Q16880 541 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNK18Q7Z418 384 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 OXR1Q8N573 874 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 FBXO41Q8TF61 875 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 ASB15Q8WXK1 588 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 GBP4Q96PP9 640 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 CSRNP2Q9H175 543 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 EDARQ9UNE0 448 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 AP1G1O43747 822 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 HERVK_113P62684 666 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 GRIN1Q05586 938 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 GALEQ14376 348 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC62Q6P9F0 684 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 SIRT2Q8IXJ6 389 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 PJA1Q8NG27 643 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC35G2Q8TBE7 412 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 TAAR9Q96RI9 348 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 RXFP1Q9HBX9 757 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 PRDM7Q9NQW5 492 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 OFD1O75665 1012 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 LDHAP00338 332 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PGGT1B-205ENST00000514178 ADKP55263 362 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms