RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 Q6ZUG5 572 aa19.27■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 PLA2G4DQ86XP0 818 aa19.27■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 UIMC1Q96RL1 719 aa19.27■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa19.26■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa19.26■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 BACH1O14867 736 aa19.26■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 ADAMTS3O15072 1205 aa19.26■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 DGKIO75912 1065 aa19.26■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 SCG2P13521 617 aa19.26■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 IL9P15248 144 aa19.26■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 SLC26A2P50443 739 aa19.26■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 MTHFD1LQ6UB35 978 aa19.26■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 ABHD15Q6UXT9 468 aa19.26■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 NIPA1Q7RTP0 329 aa19.26■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 NEK9Q8TD19 979 aa19.26■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP19.26■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 KCNB2Q92953 911 aa19.26■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
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HERC3-211ENST00000513325 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 PADI3Q9ULW8 664 aa19.26■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 RWDD3Q9Y3V2 267 aa19.26■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa19.26■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa19.25■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa19.25■□□□□ 0.67
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HERC3-211ENST00000513325 DHX15O43143 795 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 FAM160B1Q5W0V3 765 aa19.25■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 EP400NLQ6ZTU2 488 aa19.25■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 NME8Q8N427 588 aa19.25■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 CRYGNQ8WXF5 182 aa19.25■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 BRF1Q92994 677 aa19.25■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 FTHL17Q9BXU8 183 aa19.25■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 TTC3P53804 2025 aa19.25■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa19.24■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 ESYT2A0FGR8 921 aa19.24■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 GRXCR2A6NFK2 248 aa19.24■□□□□ 0.67
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HERC3-211ENST00000513325 HBP1O60381 514 aa19.24■□□□□ 0.67
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HERC3-211ENST00000513325 PAK2Q13177 524 aa19.24■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa19.24■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 FAM178BQ8IXR5 827 aa19.24■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 CRIPAKQ8N1N5 446 aa19.24■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 ATP8B4Q8TF62 1192 aa19.24■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 ZMYND12Q9H0C1 365 aa19.24■□□□□ 0.67
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF302Q9NR11 478 aa19.24■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 SNX14Q9Y5W7 946 aa19.24■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa19.24■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 HSPA4P34932 840 aa19.23■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 COL19A1Q14993 1142 aa19.23■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 PKN1Q16512 942 aa19.23■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 TMEM266Q2M3C6 531 aa19.23■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 SWSAP1Q6NVH7 229 aa19.23■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa19.23■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 PDXDC2PQ6P474 469 aa19.23■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 NPAS4Q8IUM7 802 aa19.23■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 GJD3Q8N144 294 aa19.23■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 ZNF577Q9BSK1 485 aa19.23■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 LRFN3Q9BTN0 628 aa19.23■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 TMX1Q9H3N1 280 aa19.23■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 CLDND1Q9NY35 253 aa19.23■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 GINS2Q9Y248 185 aa19.23■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 PPFIA3O75145 1194 aa19.22■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 CSPG5O95196 566 aa19.22■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa19.22■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 PHKBQ93100 1093 aa19.22■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 PLVAPQ9BX97 442 aa19.22■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
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HERC3-211ENST00000513325 ATP4AP20648 1035 aa19.21■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 RPS6KB1P23443 525 aa19.21■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 ZNF484Q5JVG2 852 aa19.21■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 TMEM31Q5JXX7 168 aa19.21■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 MCTP2Q6DN12 878 aa19.21■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 RASGRP4Q8TDF6 673 aa19.21■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 CDHR5Q9HBB8 845 aa19.21■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D22BQ9NU19 505 aa19.21■□□□□ 0.67
HERC3-211ENST00000513325 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
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