RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 SPAG5Q96R06 1193 aa30.68■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 UIMC1Q96RL1 719 aa30.68■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 REEP2Q9BRK0 252 aa30.68■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 PACSIN1Q9BY11 444 aa30.68■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 EPB41L5Q9HCM4 733 aa30.68■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa30.67■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 EXOC3L4Q17RC7 722 aa30.67■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 POTEAQ6S8J7 498 aa30.67■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 SFR1Q86XK3 245 aa30.67■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 KCTD17Q8N5Z5 321 aa30.67■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 USP38Q8NB14 1042 aa30.67■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 SLX4Q8IY92 1834 aa30.67■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 PRKCIP41743 596 aa30.67■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 SKOR1P84550 965 aa30.67■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 GUCY2DQ02846 1103 aa30.67■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 G3V3G9 751 aa30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 RPL13P26373 211 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 SREBF1P36956 1147 aa30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 CARSP49589 748 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 DCAF8Q5TAQ9 597 aa30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 PODNQ7Z5L7 613 aa30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 WHAMMQ8TF30 809 aa30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 LENG9Q96B70 501 aa30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 ZDHHC15Q96MV8 337 aa30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 ZIM3Q96PE6 472 aa30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 TMEM59LQ9UK28 342 aa30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 NFU1Q9UMS0 254 aa30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 RAD21O60216 631 aa30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 PON1P27169 355 aa30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 CRKP46108 304 aa30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 CORO7P57737 925 aa30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 PSMC6P62333 389 aa30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 RPS6KA1Q15418 735 aa30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 PBKQ96KB5 322 aa30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 KRT12Q99456 494 aa30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 FAM107BQ9H098 131 aa30.66■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 SLC9A1P19634 815 aa30.65■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 HOXD13P35453 343 aa30.65■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 IQCKQ8N0W5 287 aa30.65■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 STK32BQ9NY57 414 aa30.65■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 PI4KBQ9UBF8 816 aa30.65■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 SPDYE3A6NKU9 549 aa30.64■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 ACTN1P12814 892 aa30.64■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 CIITAP33076 1130 aa30.64■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 MAGEA9P43362 315 aa30.64■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 MMP14P50281 582 aa30.64■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 TTMPQ5BVD1 217 aa30.64■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 CFAP58Q5T655 872 aa30.64■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 ZFPM1Q8IX07 1006 aa30.64■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP30.64■■■□□ 2.57e-7■□□□□ 9.9
UBP1-201ENST00000283628 FLOT1O75955 427 aa30.64■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 EPHA7Q15375 998 aa30.64■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 FBXO11Q86XK2 927 aa30.64■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 CD302Q8IX05 232 aa30.64■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 MRIQ9BWK5 157 aa30.64■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 NAGPAQ9UK23 515 aa30.64■■■□□ 2.5
UBP1-201ENST00000283628 MYBP10242 640 aa30.63■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 DNA2P51530 1060 aa30.63■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa30.63■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 MEIS1O00470 390 aa30.62■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 KIF4AO95239 1232 aa30.62■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 IFT81Q8WYA0 676 aa30.62■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 ARL8AQ96BM9 186 aa30.62■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 GMCL1Q96IK5 515 aa30.62■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 NR3C1P04150 777 aa30.62■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 TATDN1Q6P1N9 297 aa30.62■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 TMEM179Q6ZVK1 233 aa30.62■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 VPS36Q86VN1 386 aa30.62■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 ACTRT1Q8TDG2 376 aa30.62■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa30.62■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 CNKSR1Q969H4 720 aa30.62■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 DBNDD1Q9H9R9 158 aa30.62■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 GRIN2DO15399 1336 aa30.62■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 FAM86B1E9PN63 330 aa30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 AKAP3O75969 853 aa30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 FAM86B2P0C5J1 330 aa30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 ICA1Q05084 483 aa30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 LRRC57Q8N9N7 239 aa30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 IDI2Q9BXS1 227 aa30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 NENFQ9UMX5 172 aa30.61■■■□□ 2.49
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