RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264734.2

CLDN16-201, Transcript of claudin 16, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN16, Length 3,273 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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