RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249700.8

TMOD2-201, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD2, Length 9,191 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-201ENST00000249700 PPFIA1Q13136 1202 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 XKR9Q5GH70 373 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 LRP5O75197 1615 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 NR3C1P04150 777 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 CAP2P40123 477 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 NPEPPSP55786 919 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 SPDYE2Q495Y8 402 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 TATDN1Q6P1N9 297 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 LXNQ9BS40 222 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 ZBED4O75132 1171 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 PBX1P40424 430 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 MMS19Q96T76 1030 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 LAMB4A4D0S4 1761 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 TADA3O75528 432 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 EPB41P11171 864 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 CASP5P51878 434 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 METTL13Q8N6R0 699 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 SCFD1Q8WVM8 642 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 ANKRD7Q92527 254 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 TSNARE1Q96NA8 513 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 MYO3BQ8WXR4 1341 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 ABCB4P21439 1286 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 LRRC63Q05C16 580 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 RNF146Q9NTX7 359 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 CENPPQ6IPU0 288 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 CEP112Q8N8E3 955 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 NUP58Q9BVL2 599 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 DUOX1Q9NRD9 1551 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 KRT13P13646 458 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 KCNJ6P48051 423 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 PADI6Q6TGC4 694 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 OGFRQ9NZT2 677 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 SLC9A1P19634 815 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 CASP4P49662 377 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 EHHADHQ08426 723 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 LLGL1Q15334 1064 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 TMX2Q9Y320 296 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 TISP43B9A030 160 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 DNAJC19Q96DA6 116 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 RMDN3Q96TC7 470 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 GYS2P54840 703 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 KCNH2Q12809 1159 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 EXOC3L4Q17RC7 722 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 VPS36Q86VN1 386 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 RAET1EQ8TD07 263 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 GMCL1Q96IK5 515 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 DNAJC7Q99615 494 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 A0A1W2PQC6 194 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 ASIC2Q16515 512 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 ARHGEF16Q5VV41 709 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 PDXDC1Q6P996 788 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-201ENST00000249700 WDR18Q9BV38 432 aa6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms