RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 SYF2O95926 243 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
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TTL-201ENST00000233336 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP10.94□□□□□ -0.66
TTL-201ENST00000233336 OLFM3Q96PB7 478 aa10.94□□□□□ -0.66
TTL-201ENST00000233336 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
TTL-201ENST00000233336 NDE1Q9NXR1 346 aa10.94□□□□□ -0.66
TTL-201ENST00000233336 IQCB1Q15051 598 aa10.94□□□□□ -0.66
TTL-201ENST00000233336 ASPRV1Q53RT3 343 aa10.94□□□□□ -0.66
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TTL-201ENST00000233336 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
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TTL-201ENST00000233336 GOLGA8SH3BPF8 625 aa10.94□□□□□ -0.66
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TTL-201ENST00000233336 PCGF5Q86SE9 256 aa10.94□□□□□ -0.66
TTL-201ENST00000233336 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
TTL-201ENST00000233336 USP40Q9NVE5 1235 aa10.94□□□□□ -0.66
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TTL-201ENST00000233336 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa10.94□□□□□ -0.66
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TTL-201ENST00000233336 PARP3Q9Y6F1 533 aa10.94□□□□□ -0.66
TTL-201ENST00000233336 KRT14P02533 472 aa10.94□□□□□ -0.66
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TTL-201ENST00000233336 MDH1P40925 334 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
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TTL-201ENST00000233336 MED10Q9BTT4 135 aa10.93□□□□□ -0.66
TTL-201ENST00000233336 ARHGEF9O43307 516 aa10.93□□□□□ -0.66
TTL-201ENST00000233336 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
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TTL-201ENST00000233336 ITKQ08881 620 aa10.93□□□□□ -0.66
TTL-201ENST00000233336 PRPSAP1Q14558 356 aa10.93□□□□□ -0.66
TTL-201ENST00000233336 FIS1Q9Y3D6 152 aa10.93□□□□□ -0.66
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