RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NPIPB4-222	ENST00000614197	WNT8B	Q93098	351 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NPIPB4-222	ENST00000614197	PHKB	Q93100	1093 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NPIPB4-222	ENST00000614197	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NPIPB4-222	ENST00000614197	CERS4	Q9HA82	394 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NPIPB4-222	ENST00000614197	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NPIPB4-222	ENST00000614197	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NPIPB4-222	ENST00000614197	THEG	Q9P2T0	379 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NPIPB4-222	ENST00000614197	INSL6	Q9Y581	213 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NPIPB4-222	ENST00000614197	SZT2	Q5T011	3432 aa		12.46	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	NID2	Q14112	1375 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	CYP3A4	P08684	503 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	XBP1	P17861	261 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	DEFB103A	P81534	67 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	TAP1	Q03518	808 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	RPAIN	Q86UA6	219 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	YME1L1	Q96TA2	773 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	POTEB3	A0JP26	581 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	INSRR	P14616	1297 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	EVC	P57679	992 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	KRT76	Q01546	638 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	MBTPS1	Q14703	1052 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	GPNMB	Q14956	572 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANKRD1	Q15327	319 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	AAK1	Q2M2I8	961 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRR16	Q569H4	304 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM26D	Q5JW98	314 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	POTEB	Q6S5H4	581 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF302	Q9NR11	478 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	SAMM50	Q9Y512	469 aa		12.44	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	HBP1	O60381	514 aa		12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	PPFIA3	O75145	1194 aa		12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	UPP2	O95045	317 aa		12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	DEXI	O95424	95 aa		12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	PSAP	P07602	524 aa		12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	GHR	P10912	638 aa		12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	ADAM17	P78536	824 aa		12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	STK3	Q13188	491 aa		12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	ADGRE1	Q14246	886 aa		12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	PKN1	Q16512	942 aa		12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	ODR4	Q5SWX8	454 aa		12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	GALNT17	Q6IS24	598 aa		12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	USP38	Q8NB14	1042 aa		12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	SAMD11	Q96NU1	681 aa		12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM86B1	E9PN63	330 aa		12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	USP11	P51784	963 aa		12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANAPC15	P60006	121 aa		12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	PLCB4	Q15147	1175 aa		12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	NME8	Q8N427	588 aa		12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM167A	Q96KS9	214 aa		12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		12.42	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		12.41	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	WDR64	B1ANS9	1081 aa		12.41	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	RFXAP	O00287	272 aa		12.41	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	GAS7	O60861	476 aa		12.41	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATG7	O95352	703 aa		12.41	□□□□□ -0.42
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHRNA1	P02708	482 aa		12.41	□□□□□ -0.42

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