RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563892.5

USP10-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 3

Gene USP10, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-210ENST00000563892 EMSYQ7Z589 1322 aa20.15■□□□□ 0.82
USP10-210ENST00000563892 MYH11P35749 1972 aa20.15■□□□□ 0.82
USP10-210ENST00000563892 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa20.14■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 POTEMA6NI47 508 aa20.14■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 H3BRB1 525 aa20.14■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 F2P00734 622 aa20.14■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 COL6A1P12109 1028 aa20.14■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 PSEN2P49810 448 aa20.14■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.811e-6■■□□□ 14.2
USP10-210ENST00000563892 STAT5BP51692 787 aa20.14■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 CHMP4BP1P59074 171 aa20.14■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 STK38Q15208 465 aa20.14■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 IL17AQ16552 155 aa20.14■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 SWSAP1Q6NVH7 229 aa20.14■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 RAB34Q9BZG1 259 aa20.14■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 ZNF302Q9NR11 478 aa20.14■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 CFAP45Q9UL16 551 aa20.14■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.13■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 PSMC6P62333 389 aa20.13■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 MFSD10Q14728 455 aa20.13■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 SLC39A14Q15043 492 aa20.13■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 EPHA7Q15375 998 aa20.13■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.13■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.13■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.13■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 GABBR1Q9UBS5 961 aa20.13■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 YEATS4O95619 227 aa20.12■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 KRT85P78386 507 aa20.12■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 ITGA7Q13683 1181 aa20.12■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 PDIA5Q14554 519 aa20.12■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.12■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.12■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.12■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20.12■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.12■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.11■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 HAS3O00219 553 aa20.11■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 MARK3P27448 753 aa20.11■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.11■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.11■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 BANK1Q8NDB2 785 aa20.11■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.11■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.11■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 GRIN2DO15399 1336 aa20.1■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 SPTLC2O15270 562 aa20.1■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 SLC26A2P50443 739 aa20.1■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 UGCGQ16739 394 aa20.1■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.1■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 ERMNQ8TAM6 284 aa20.1■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa20.1■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 ATP6V0A1Q93050 837 aa20.1■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 DYDC2Q96IM9 177 aa20.1■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.1■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 RGL1Q9NZL6 768 aa20.1■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 ARVCFO00192 962 aa20.09■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 PSMC5P62195 406 aa20.09■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 CYP4A11Q02928 519 aa20.09■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 PLCB4Q15147 1175 aa20.09■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.09■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 C7orf31Q8N865 590 aa20.09■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 NEK9Q8TD19 979 aa20.09■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 POTEB3A0JP26 581 aa20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 PP2D1A8MPX8 630 aa20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 ZNF862O60290 1169 aa20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.814e-7■■■■■ 32.2
USP10-210ENST00000563892 PPP6R2O75170 966 aa20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 ATP4AP20648 1035 aa20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 GRIN1Q05586 938 aa20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 POTEBQ6S5H4 581 aa20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 TPH2Q8IWU9 490 aa20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 LXNQ9BS40 222 aa20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 TRPC6Q9Y210 931 aa20.08■□□□□ 0.81
USP10-210ENST00000563892 STK24Q9Y6E0 443 aa20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms