RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 INSRRP14616 1297 aa22.01■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 KCNA5P22460 613 aa22.01■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.01■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 FIBCD1Q8N539 461 aa22.01■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 SDF4Q9BRK5 362 aa22.01■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.01■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 TRPC6Q9Y210 931 aa22.01■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 SMCO2A6NFE2 343 aa22■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 ENPP3O14638 875 aa22■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 ADCY7P51828 1080 aa22■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 FUT2Q10981 343 aa22■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 RASEFQ8IZ41 740 aa22■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 ANO3Q9BYT9 981 aa22■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 EPHX3Q9H6B9 360 aa22■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 TMEM260Q9NX78 707 aa22■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.99■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.99■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.99■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 ACTR2P61160 394 aa21.99■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.99■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 BANK1Q8NDB2 785 aa21.99■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 MICAL3Q7RTP6 2002 aa21.99■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 STXBP3O00186 592 aa21.98■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 CTNNB1P35222 781 aa21.98■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF76P36508 570 aa21.98■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 PLCB4Q15147 1175 aa21.98■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 LEXMQ3ZCV2 418 aa21.98■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 CEP55Q53EZ4 464 aa21.98■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.98■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.98■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 EP400NLQ6ZTU2 488 aa21.98■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa21.98■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 CDC27P30260 824 aa21.97■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 CD52P31358 61 aa21.97■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 STAT5BP51692 787 aa21.97■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 TMEM62Q0P6H9 643 aa21.97■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.97■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 TIGD5Q53EQ6 642 aa21.97■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 TCEAL5Q5H9L2 206 aa21.97■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 IER5Q5VY09 327 aa21.97■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 BARHL2Q9NY43 387 aa21.97■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 NFASCO94856 1347 aa21.97■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 SIP14410 1827 aa21.96■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.96■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 M0QZ92 97 aa21.96■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 BMPR1AP36894 532 aa21.96■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 FGD1P98174 961 aa21.96■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 KRT32Q14532 448 aa21.96■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.96■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 CD320Q9NPF0 282 aa21.96■■□□□ 1.11
SHQ1-206ENST00000471526 POTEB3A0JP26 581 aa21.95■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 H3BQ06 376 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 MEIS1O00470 390 aa21.95■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 CDC45O75419 566 aa21.95■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 SREBF1P36956 1147 aa21.95■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.95■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 POTEBQ6S5H4 581 aa21.95■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.95■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.95■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.95■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 TRPV2Q9Y5S1 764 aa21.95■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa21.95■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 RB1P06400 928 aa21.94■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 CPA1P15085 419 aa21.94■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 IL9P15248 144 aa21.94■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 AP3B2Q13367 1082 aa21.94■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 UIMC1Q96RL1 719 aa21.94■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 C5orf67F2Z3F1 127 aa21.93■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 BACH1O14867 736 aa21.93■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 GRM6O15303 877 aa21.93■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 CSPG5O95196 566 aa21.93■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 ATG7O95352 703 aa21.93■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 LINC00271P0C7V0 271 aa21.93■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.93■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.93■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 FAM178BQ8IXR5 827 aa21.93■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 LINC01599Q8WXQ3 324 aa21.93■■□□□ 1.1
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms