RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 DCAF4Q8WV16 495 aa23.58■■□□□ 1.37
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PTDSS1-201ENST00000337004 PACSIN1Q9BY11 444 aa23.58■■□□□ 1.37
PTDSS1-201ENST00000337004 NFU1Q9UMS0 254 aa23.58■■□□□ 1.37
PTDSS1-201ENST00000337004 STK24Q9Y6E0 443 aa23.58■■□□□ 1.37
PTDSS1-201ENST00000337004 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PTDSS1-201ENST00000337004 TBX3O15119 743 aa23.58■■□□□ 1.37
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PTDSS1-201ENST00000337004 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PTDSS1-201ENST00000337004 TEKT1Q969V4 418 aa23.58■■□□□ 1.37
PTDSS1-201ENST00000337004 KRT12Q99456 494 aa23.58■■□□□ 1.37
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PTDSS1-201ENST00000337004 MAGEA9P43362 315 aa23.57■■□□□ 1.36
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PTDSS1-201ENST00000337004 ARHGAP4P98171 946 aa23.57■■□□□ 1.36
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PTDSS1-201ENST00000337004 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 MKL1Q969V6 931 aa23.57■■□□□ 1.36
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PTDSS1-201ENST00000337004 RPA1P27694 616 aa23.57■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 CORO7P57737 925 aa23.57■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 CFAP58Q5T655 872 aa23.57■■□□□ 1.36
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PTDSS1-201ENST00000337004 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.56■■□□□ 1.36
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PTDSS1-201ENST00000337004 RPS6KA1Q15418 735 aa23.56■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 EXOC3L4Q17RC7 722 aa23.56■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM107BQ9H098 131 aa23.56■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 FOCADQ5VW36 1801 aa23.56■■□□□ 1.36
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PTDSS1-201ENST00000337004 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 ACTN1P12814 892 aa23.56■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC9A1P19634 815 aa23.56■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 GNGT1P63211 74 aa23.56■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.56■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 Q4G0T1 1027 aa23.56■■□□□ 1.36
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PTDSS1-201ENST00000337004 ARL8AQ96BM9 186 aa23.56■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 MXD3Q9BW11 206 aa23.56■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 NYAP2Q9P242 653 aa23.56■■□□□ 1.36
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PTDSS1-201ENST00000337004 WHAMMQ8TF30 809 aa23.55■■□□□ 1.36
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PTDSS1-201ENST00000337004 SKOR1P84550 965 aa23.55■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 NFIAQ12857 509 aa23.55■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 SFR1Q86XK3 245 aa23.55■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.55■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 REEP2Q9BRK0 252 aa23.55■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 AMNQ9BXJ7 453 aa23.55■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 ESYT3A0FGR9 886 aa23.54■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 MEIS1O00470 390 aa23.54■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 RPL13P26373 211 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 PON1P27169 355 aa23.54■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 DDR1Q08345 913 aa23.54■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 PBKQ96KB5 322 aa23.54■■□□□ 1.36
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PTDSS1-201ENST00000337004 SHTN1A0MZ66 631 aa23.54■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 KCNK3O14649 394 aa23.54■■□□□ 1.36
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PTDSS1-201ENST00000337004 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.54■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 ANXA13P27216 316 aa23.54■■□□□ 1.36
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PTDSS1-201ENST00000337004 FAM153CQ494X1 144 aa23.54■■□□□ 1.36
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PTDSS1-201ENST00000337004 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.53■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 G3V3G9 751 aa23.53■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 EBAG9O00559 213 aa23.53■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 FLOT1O75955 427 aa23.53■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 DOK7Q18PE1 504 aa23.53■■□□□ 1.36
PTDSS1-201ENST00000337004 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.53■■□□□ 1.36
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