RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 LRRC63Q05C16 580 aa22.48■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.48■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 SCFD2Q8WU76 684 aa22.48■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 ANKS1AQ92625 1134 aa22.48■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.47■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 PAEPP09466 180 aa22.47■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 TXKP42681 527 aa22.47■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.192e-6■■■■□ 23.8
PMS1-222ENST00000639501 C3orf20Q8ND61 904 aa22.47■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 MDM1Q8TC05 714 aa22.47■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 CCT6BQ92526 530 aa22.47■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.47■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.47■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 F8W031 263 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 SART1O43290 800 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 CEP104O60308 925 aa22.47■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 KLRK1P26718 216 aa22.47■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 BIRC3Q13489 604 aa22.47■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 CUL1Q13616 776 aa22.47■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 KCNK18Q7Z418 384 aa22.47■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 CALML4Q96GE6 196 aa22.47■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.47■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 DAPK3O43293 454 aa22.46■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 KIF4AO95239 1232 aa22.46■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 ITGA4P13612 1032 aa22.46■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 DRD4P21917 467 aa22.46■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 XRCC4Q13426 336 aa22.46■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 RPS6KA1Q15418 735 aa22.46■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 LRRC45Q96CN5 670 aa22.46■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 HVCN1Q96D96 273 aa22.46■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.46■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 TAF4BQ92750 862 aa22.46■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 CCDC189A1A4V9 331 aa22.45■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 FAM182BQ5T319 152 aa22.45■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 TLDC1Q6P9B6 456 aa22.45■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 AMACRQ9UHK6 382 aa22.45■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 POTEMA6NI47 508 aa22.45■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 PAX7P23759 505 aa22.45■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 PRDX5P30044 214 aa22.45■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 NAPAP54920 295 aa22.45■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 KLHL30Q0D2K2 578 aa22.45■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.45■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.45■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 NEK8Q86SG6 692 aa22.45■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.45■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.44■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 USP11P51784 963 aa22.44■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 ACCSLQ4AC99 568 aa22.44■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 AGBL2Q5U5Z8 902 aa22.44■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 GALNT17Q6IS24 598 aa22.44■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.44■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 TBCKQ8TEA7 893 aa22.44■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 DDX12PQ92771 950 aa22.44■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.44■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.44■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.44■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 KRT71Q3SY84 523 aa22.43■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 MGRN1O60291 552 aa22.43■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 METTL13Q8N6R0 699 aa22.43■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 LRRC57Q8N9N7 239 aa22.43■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 MAGEC3Q8TD91 643 aa22.43■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 TMEM260Q9NX78 707 aa22.43■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 JAG2Q9Y219 1238 aa22.43■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.43■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 TRAF5O00463 557 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 RPSAP08865 295 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 CPLX4Q7Z7G2 160 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 DGKHQ86XP1 1220 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 TMCO5BA8MYB1 307 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 F8VZ95 297 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 TTI1O43156 1089 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 NTSR2O95665 410 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 ACTRT1Q8TDG2 376 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-222ENST00000639501 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22.42■■□□□ 1.18
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