RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 ALG1Q9BT22 464 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 CAND2O75155 1236 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 LY6KQ17RY6 165 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 TCTN1Q2MV58 587 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 RNF135Q8IUD6 432 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 CFBP00751 764 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 THPOP40225 353 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 GNAQP50148 359 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 TRAF1Q13077 416 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 PRSS33Q8NF86 280 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 APBB2Q92870 758 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 KCNB2Q92953 911 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 TECTAO75443 2155 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 STXBP3O00186 592 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 HAS3O00219 553 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 MBTPS2O43462 519 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 FGD1P98174 961 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 MBTPS1Q14703 1052 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 MICU3Q86XE3 530 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM221A6NGB7 291 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 M0R296 226 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 CPA1P15085 419 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 SERINC5Q86VE9 423 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 FIBCD1Q8N539 461 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 FANCBQ8NB91 859 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 COL20A1Q9P218 1284 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 CD207Q9UJ71 328 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 OPLAHO14841 1288 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 GFRA3O60609 400 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 PPFIA4O75335 1185 aa22.1■■□□□ 1.13
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SGMS1-208ENST00000608287 LTBRP36941 435 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 APOA5Q6Q788 366 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 IL17RAQ96F46 866 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 RMDN3Q96TC7 470 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 WDFY4Q6ZS81 3184 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 UPP2O95045 317 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF286BP0CG31 522 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 HSD17B4P51659 736 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 PHOX2BQ99453 314 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 ZBTB43O43298 467 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 FBXL6Q8N531 539 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 USP26Q9BXU7 913 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-208ENST00000608287 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.07■■□□□ 1.12
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SGMS1-208ENST00000608287 PSMA5P28066 241 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 NUBP1P53384 320 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 Q6ZUG5 572 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 WNT8BQ93098 351 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 PLVAPQ9BX97 442 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 MYO7AQ13402 2215 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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