RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-222ENST00000567147 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 NOP56O00567 594 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 RPS6KB1P23443 525 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 PSMA5P28066 241 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 NAPAP54920 295 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 FAM117BQ6P1L5 589 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 METTL7BQ6UX53 244 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 NLRX1Q86UT6 975 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 ITGB5P18084 799 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 FBXL16Q8N461 479 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 GPR20Q99678 358 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 SENP7Q9BQF6 1050 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 RIC8AQ9NPQ8 531 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 SIP14410 1827 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 SMCO2A6NFE2 343 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 H3BRB1 525 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 STXBP3O00186 592 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 KCNA5P22460 613 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 LRRC8DQ7L1W4 858 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 CAGE1Q8TC20 777 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 GPRASP2Q96D09 838 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 UIMC1Q96RL1 719 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 USP26Q9BXU7 913 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 BARHL2Q9NY43 387 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 TELO2Q9Y4R8 837 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 NBNO60934 754 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 ATP9AO75110 1047 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 LGALS2P05162 132 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 SELPP16109 830 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 HIC1Q14526 733 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 PPP1R18Q6NYC8 613 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 CDHR1Q96JP9 859 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-222ENST00000567147 LINC01553A4QN01 128 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 hCG_1984214I3L0E3 225 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 IL9P15248 144 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 ADCY7P51828 1080 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 SP4Q02446 784 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 PTK7Q13308 1070 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 RUFY3Q7L099 469 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 GJD3Q8N144 294 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 JADE2Q9NQC1 790 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 LMCD1Q9NZU5 365 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 GJB5O95377 273 aa20■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 FOSP01100 380 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 CKBP12277 381 aa20■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 KCNA2P16389 499 aa20■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 ERVK-21P61565 698 aa20■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 MTMR1Q13613 665 aa20■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 FAM178BQ8IXR5 827 aa20■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 PGBD1Q96JS3 809 aa20■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 RAD9AQ99638 391 aa20■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 TMEM260Q9NX78 707 aa20■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 MAFGO15525 162 aa19.99■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa19.99■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa19.99■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 SCG2P13521 617 aa19.99■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 RBL2Q08999 1139 aa19.99■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 WNT8BQ93098 351 aa19.99■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 MXRA8Q9BRK3 442 aa19.99■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 C17orf80Q9BSJ5 609 aa19.99■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 GLT8D2Q9H1C3 349 aa19.99■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa19.99■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 PIEZO1Q92508 2521 aa19.98■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 C17orf102A2RUQ5 167 aa19.98■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 PRR33A8MZF0 331 aa19.98■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 EVCP57679 992 aa19.98■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 PKN1Q16512 942 aa19.98■□□□□ 0.79
RNPS1-222ENST00000567147 LEXMQ3ZCV2 418 aa19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms