RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531188.5

RPS3-217, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS3, Length 2,097 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-217ENST00000531188 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 SETQ01105 290 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 PPP2R5CQ13362 524 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 ARHGEF16Q5VV41 709 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 UNC13DQ70J99 1090 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 ARMC9Q7Z3E5 817 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 KIAA0895Q8NCT3 520 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 SLC39A2Q9NP94 309 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 MYH11P35749 1972 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 CXCL11O14625 94 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 SLC26A4O43511 780 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 IDEP14735 1019 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 GJA5P36382 358 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 SLC12A3P55017 1021 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 PPIL2Q13356 520 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 MOGSQ13724 837 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 ARID5BQ14865 1188 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 TERF2Q15554 542 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 LBX2Q6XYB7 198 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 DYDC2Q96IM9 177 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 HSD17B14Q9BPX1 270 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 ACAD9Q9H845 621 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 INTS13Q9NVM9 706 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 CYP39A1Q9NYL5 469 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 KCNH4Q9UQ05 1017 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 SLITRK3O94933 977 aa13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 BCRP11274 1271 aa13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 CYP11B2P19099 503 aa13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP13.56□□□□□ -0.242e-37■■■□□ 18
RPS3-217ENST00000531188 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 ARSHQ5FYA8 562 aa13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 LDLRAD1Q5T700 205 aa13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 CDKAL1Q5VV42 579 aa13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 CEP135Q66GS9 1140 aa13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 CNNM4Q6P4Q7 775 aa13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 B3GNT9Q6UX72 402 aa13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 GPBP1Q86WP2 473 aa13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 GLIS3Q8NEA6 775 aa13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 RRAGCQ9HB90 399 aa13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 JADE2Q9NQC1 790 aa13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 FAM53CQ9NYF3 392 aa13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa13.56□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 DHX15O43143 795 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 EHHADHQ08426 723 aa13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 LRMPQ12912 555 aa13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 SEMA3FQ13275 785 aa13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 MTMR1Q13613 665 aa13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 NIPA1Q7RTP0 329 aa13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 TMC6Q7Z403 805 aa13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 TPH2Q8IWU9 490 aa13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 ERO1AQ96HE7 468 aa13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 TEKT3Q9BXF9 490 aa13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 LRRC27Q9C0I9 530 aa13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 DNM3Q9UQ16 869 aa13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 ZBTB39O15060 712 aa13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 ATP9AO75110 1047 aa13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 POTEHQ6S545 545 aa13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 PIGOQ8TEQ8 1089 aa13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 RIT2Q99578 217 aa13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 PAGR1Q9BTK6 254 aa13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 KCND1Q9NSA2 647 aa13.55□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 CNMDO75829 334 aa13.54□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 NR3C2P08235 984 aa13.54□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 COASYQ13057 564 aa13.54□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 VSIG10LQ86VR7 867 aa13.54□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 BHMT2Q9H2M3 363 aa13.54□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 PANK4Q9NVE7 773 aa13.54□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa13.54□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa13.54□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 STK24Q9Y6E0 443 aa13.54□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 PSMA7O14818 248 aa13.54□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 CBFA2T2O43439 604 aa13.54□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 HERVK_113P62684 666 aa13.54□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 STIM1Q13586 685 aa13.54□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 LRRC41Q15345 812 aa13.54□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 ANKRD40Q6AI12 368 aa13.54□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 GPAT2Q6NUI2 795 aa13.54□□□□□ -0.24
RPS3-217ENST00000531188 TTI2Q6NXR4 508 aa13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms