RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527197.5

PUF60-209, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PUF60, Length 1,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-209ENST00000527197 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 FAM86B1E9PN63 330 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 FAM86B2P0C5J1 330 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 POLR2MP0CAP2 368 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 STAT3P40763 770 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 DNM2P50570 870 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 NCAPH2Q6IBW4 605 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 FOXR2Q6PJQ5 311 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 CPLX3Q8WVH0 158 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 HPS3Q969F9 1004 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 DNAJC19Q96DA6 116 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 MS4A4AQ96JQ5 239 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 KIAA1024Q9UPX6 916 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 E9PMD0 336 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 MED24O75448 989 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 PLA2G4BP0C869 781 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 ZNF76P36508 570 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 ETF1P62495 437 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 LRRC63Q05C16 580 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 SYT10Q6XYQ8 523 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 GPBP1Q86WP2 473 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 CCDC65Q8IXS2 484 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 ZNF507Q8TCN5 953 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 BRI3BPQ8WY22 251 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 OTUD5Q96G74 571 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 TSG101Q99816 390 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 ZNF341Q9BYN7 854 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 SEMA6BQ9H3T3 888 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 ABHD10Q9NUJ1 306 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 TRIM17Q9Y577 477 aa16.04■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 SOWAHDA6NJG2 315 aa16.03■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 PES1O00541 588 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 MSH4O15457 936 aa16.03■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 CFBP00751 764 aa16.03■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 CCDC175P0C221 793 aa16.03■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 SYCP1Q15431 976 aa16.03■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 FAM26FQ5R3K3 315 aa16.03■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 UIMC1Q96RL1 719 aa16.03■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 WRNIP1Q96S55 665 aa16.03■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 PANK4Q9NVE7 773 aa16.03■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 VAV3Q9UKW4 847 aa16.03■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa16.02■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa16.02■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 POTEFA5A3E0 1075 aa16.02■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 PHF20L1A8MW92 1017 aa16.02■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 B4DLN1 442 aa16.02■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 WDR46O15213 610 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 RPA1P27694 616 aa16.02■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 CCL15Q16663 113 aa16.02■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 POTEGQ6S5H5 508 aa16.02■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 POTEEQ6S8J3 1075 aa16.02■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 OTOP1Q7RTM1 612 aa16.02■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 MYOCDQ8IZQ8 938 aa16.02■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 CD99L2Q8TCZ2 262 aa16.02■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 LPAR1Q92633 364 aa16.02■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa16.02■□□□□ 0.16
PUF60-209ENST00000527197 HTTP42858 3142 aa16.02■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 SPDYE5A6NIY4 337 aa16.01■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 CYP11B2P19099 503 aa16.01■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 GTF2A2P52657 109 aa16.01■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 MTF1Q14872 753 aa16.01■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 TRIM65Q6PJ69 517 aa16.01■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 RAD9BQ6WBX8 426 aa16.01■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 TMTC1Q8IUR5 882 aa16.01■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 DESI2Q9BSY9 194 aa16.01■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 FBXO28Q9NVF7 368 aa16.01■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 KIF20AO95235 890 aa16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 ICAM1P05362 532 aa16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 KRT18P05783 430 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 KRT9P35527 623 aa16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 SLC12A3P55017 1021 aa16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 RBM10P98175 930 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 CYP26C1Q6V0L0 522 aa16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 CATSPER3Q86XQ3 398 aa16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 KCTD17Q8N5Z5 321 aa16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 TSC1Q92574 1164 aa16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 HOOK2Q96ED9 719 aa16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 ERO1AQ96HE7 468 aa16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 MAP7D2Q96T17 732 aa16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 DNAI1Q9UI46 699 aa16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 PHIPQ8WWQ0 1821 aa16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 FRMD3A2A2Y4 597 aa16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 SETQ01105 290 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 CAP1Q01518 475 aa16■□□□□ 0.15
PUF60-209ENST00000527197 SP3Q02447 781 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.5 ms