RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 CNTD1Q8N815 330 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 LGR4Q9BXB1 951 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 TULP4Q9NRJ4 1543 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 TBX1O43435 398 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 RFPL1O75677 317 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 PYGMP11217 842 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 NAT1P18440 290 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 ITIH2P19823 946 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 OXCT1P55809 520 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 KSR2Q6VAB6 950 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 KIF18BQ86Y91 864 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 NETO1Q8TDF5 533 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 SCLYQ96I15 445 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 WNK4Q96J92 1243 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 U3KQE9 123 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 NRKQ7Z2Y5 1582 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 NEMP1O14524 444 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 GABRDO14764 452 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 FBXO21O94952 628 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 WNT11O96014 354 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 CPP00450 1065 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 CEACAM5P06731 702 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 HOXC12P31275 282 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 KCNJ6P48051 423 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.97□□□□□ -1.29
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CCL20-201ENST00000358813 GP6Q9HCN6 339 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 DLC1Q96QB1 1528 aa6.96□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 NUP188Q5SRE5 1749 aa6.96□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 BLACEA4D250 179 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 AQP7O14520 342 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 PLSCR1O15162 318 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 ABLIM3O94929 683 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 KCNH1O95259 989 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 PRNPP04156 253 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 CYP7A1P22680 504 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 GFRA1P56159 465 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 FAPQ12884 760 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 C4orf46Q504U0 113 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 CDH24Q86UP0 819 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 SYT17Q9BSW7 474 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 MENTQ9BUN1 341 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 RREB1Q92766 1687 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 CRB1P82279 1406 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 ETV3P41162 512 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 GRB10Q13322 594 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 DGKHQ86XP1 1220 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 COG1Q8WTW3 980 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 DCAF4Q8WV16 495 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 SLC39A13Q96H72 371 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-201ENST00000358813 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.95□□□□□ -1.3
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