RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 ITFG2Q969R8 447 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 C8orf48Q96LL4 319 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 TOX2Q96NM4 488 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 CEP89Q96ST8 783 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 NYXQ9GZU5 481 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 IFT57Q9NWB7 429 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 POLLQ9UGP5 575 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-209ENST00000561136 AOX1Q06278 1338 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 MYH3P11055 1940 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 ALPK3Q96L96 1907 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 TNFRSF10BO14763 440 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 SLC20A2Q08357 652 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 GRAPQ13588 217 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 PRKG1Q13976 671 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 ELP3Q9H9T3 547 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 CNTN3Q9P232 1028 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 ARAP2Q8WZ64 1704 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 ERVV-1B6SEH8 477 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 DNAJC6O75061 913 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 SASH1O94885 1247 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 FUT4P22083 530 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 USP5P45974 858 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 RAP1GAPP47736 663 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 MAP7Q14244 749 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 NFE2L2Q16236 605 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 MAP9Q49MG5 647 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 KLHL10Q6JEL2 608 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 KRT77Q7Z794 578 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 NLRP10Q86W26 655 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 RELTQ969Z4 430 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 H7C1D1 291 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 PES1O00541 588 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 FAM163BP0C2L3 166 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 CD8BP10966 210 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 NEFHP12036 1026 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 KLRK1P26718 216 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 CD151P48509 253 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 LMNTD2Q8IXW0 634 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 XAGE3Q8WTP9 111 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 TINF2Q9BSI4 451 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 LZTS1Q9Y250 596 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 UFL1O94874 794 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 PDGFRBP09619 1106 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 ADH5P11766 374 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 PPP2R1AP30153 589 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 TNIP1Q15025 636 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 ODR4Q5SWX8 454 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 LCA5Q86VQ0 697 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms