RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC49Q8IUZ0 686 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 IQCDQ96DY2 449 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 SUCLG2Q96I99 432 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 BCORL1Q5H9F3 1711 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 C19orf81C9J6K1 198 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 SERPINB13Q9UIV8 391 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 CCPG1Q9ULG6 757 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 CYP27B1O15528 508 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 FIBPO43427 364 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 SNX2O60749 519 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 SEC24BO95487 1268 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 CD53P19397 219 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 LBX1P52954 281 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 STX3Q13277 289 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 PPP2R5DQ14738 602 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 SPA17Q15506 151 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa6.84□□□□□ -1.31
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