RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541456.1

PRR4-209, Transcript of proline rich 4, human

TSL 3

Gene PRR4, Length 454 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRR4-209	ENST00000541456	SYP	P08247	313 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	COL6A1	P12109	1028 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	TRIM27	P14373	513 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	PHKG2	P15735	406 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	SDHB	P21912	280 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	SLC7A5	Q01650	507 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	E2F7	Q96AV8	911 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	HOOK2	Q96ED9	719 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	TTC1	Q99614	292 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	TNFRSF10C	O14798	259 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	SIGLEC6	O43699	453 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	RAPGEF3	O95398	923 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	PRAMEF1	O95521	474 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	SLPI	P03973	132 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	RAG1	P15918	1043 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	FAP	Q12884	760 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	TMTC2	Q8N394	836 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	ANO9	A1A5B4	782 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456		B4E1Z4	1266 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	TBX3	O15119	743 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	FKTN	O75072	461 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	FBXO21	O94952	628 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	F2	P00734	622 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	ASL	P04424	464 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	MPO	P05164	745 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	HTR3A	P46098	478 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	STRN3	Q13033	797 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	KIR3DS1	Q14943	382 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	LDHD	Q86WU2	507 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	USP7	Q93009	1102 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	TTC17	Q96AE7	1141 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	RUNDC1	Q96C34	613 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	EXOC2	Q96KP1	924 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	MRI	Q9BWK5	157 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	IFT22	Q9H7X7	185 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	ERC2	O15083	957 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	ABLIM3	O94929	683 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	FGFR1	P11362	822 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	VCAM1	P19320	739 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	STAT4	Q14765	748 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	TEX19	Q8NA77	164 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	PWWP2A	Q96N64	755 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	CHST12	Q9NRB3	414 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	USP25	Q9UHP3	1055 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PRR4-209	ENST00000541456	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PRR4-209	ENST00000541456	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
PRR4-209	ENST00000541456	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
PRR4-209	ENST00000541456	BDNF	P23560	247 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PRR4-209	ENST00000541456	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
PRR4-209	ENST00000541456	L1CAM	P32004	1257 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PRR4-209	ENST00000541456	KCNC1	P48547	511 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PRR4-209	ENST00000541456	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42

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