RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534143.5

CMTM1-220, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-220ENST00000534143 ATP2B2Q01814 1243 aa7.1□□□□□ -1.27
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CMTM1-220ENST00000534143 PRKG1Q13976 671 aa7.1□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.1□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 ASPRV1Q53RT3 343 aa7.1□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa7.1□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.1□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
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CMTM1-220ENST00000534143 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa7.1□□□□□ -1.27
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CMTM1-220ENST00000534143 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
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CMTM1-220ENST00000534143 ELOA3Q8NG57 546 aa7.09□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 PHKBQ93100 1093 aa7.09□□□□□ -1.27
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CMTM1-220ENST00000534143 DDX11Q96FC9 970 aa7.09□□□□□ -1.27
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CMTM1-220ENST00000534143 SPZ1Q9BXG8 430 aa7.09□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
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CMTM1-220ENST00000534143 PKN1Q16512 942 aa7.08□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 CST9Q5W186 159 aa7.08□□□□□ -1.28
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CMTM1-220ENST00000534143 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.08□□□□□ -1.28
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CMTM1-220ENST00000534143 TNFRSF25Q93038 417 aa7.08□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.08□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 MTMR8Q96EF0 704 aa7.08□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 MYO19Q96H55 970 aa7.08□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 CLMNQ96JQ2 1002 aa7.08□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 C12orf42Q96LP6 360 aa7.08□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 SLC26A6Q9BXS9 759 aa7.08□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 UBA5Q9GZZ9 404 aa7.08□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 SH2D4AQ9H788 454 aa7.08□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 MTMR7Q9Y216 660 aa7.08□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 ZHX2Q9Y6X8 837 aa7.08□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 PARP14Q460N5 1801 aa7.08□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 RLFQ13129 1914 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 PASKQ96RG2 1323 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 PIK3R2O00459 728 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 CELF2O95319 508 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
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