RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-240ENST00000495293 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 A0A1W2PQY0 241 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 MPOP05164 745 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 FBLN1P23142 703 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 ZNF445P59923 1031 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 CYP4F8P98187 520 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 USP35Q9P2H5 1018 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 PPT2Q9UMR5 302 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 ATRNO75882 1429 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 SSH2Q76I76 1423 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 CGNL1Q0VF96 1302 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 CD163L1Q9NR16 1453 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 VAMP1P23763 118 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 LIMS1P48059 325 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 AMPHP49418 695 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 PAK2Q13177 524 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 BRF1Q92994 677 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 PRR13Q9NZ81 148 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 KNSTRNQ9Y448 316 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 AATKQ6ZMQ8 1374 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 PIK3C2AO00443 1686 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 NRKQ7Z2Y5 1582 aa6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 FFAR3O14843 346 aa6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 FYB1O15117 783 aa6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 GSTM1P09488 218 aa6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 NFKB2Q00653 900 aa6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 LAPTM5Q13571 262 aa6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 ARHGEF25Q86VW2 580 aa6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 PWWP2AQ96N64 755 aa6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 PANK3Q9H999 370 aa6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 SLIT3O75094 1523 aa6.03□□□□□ -1.44
RBM39-240ENST00000495293 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa6.02□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 NSD3Q9BZ95 1437 aa6.02□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 ABLIM1O14639 778 aa6.02□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 GSNP06396 782 aa6.02□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 DBHP09172 617 aa6.02□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 IFNGR1P15260 489 aa6.02□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 ARL4AP40617 200 aa6.02□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.02□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.02□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.02□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.02□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 CXorf38Q8TB03 319 aa6.02□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.02□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 GP6Q9HCN6 339 aa6.02□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.02□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.02□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.02□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 WDR17Q8IZU2 1322 aa6.01□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 RGS12O14924 1447 aa6.01□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 CRB1P82279 1406 aa6.01□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 CBFA2T2O43439 604 aa6.01□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 SYN1P17600 705 aa6.01□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 VWA3BQ502W6 1294 aa6.01□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.01□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 IP6K1Q92551 441 aa6.01□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 GINM1Q9NU53 330 aa6.01□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa6.01□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 KIF7Q2M1P5 1343 aa6□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 LTBP3Q9NS15 1303 aa6□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 NRAPQ86VF7 1730 aa6□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 KIF20BQ96Q89 1820 aa6□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 A0A1B0GTL3 188 aa6□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 SASH1O94885 1247 aa6□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 ATF2P15336 505 aa6□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 TACR1P25103 407 aa6□□□□□ -1.45
RBM39-240ENST00000495293 MAPKAPK2P49137 400 aa6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms