RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 M0R2C6 588 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 N4BP3O15049 544 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 LILRA1O75019 489 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 SYF2O95926 243 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC172P0C7W6 258 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ALDH1B1P30837 517 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CASP14P31944 242 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 RDXP35241 583 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 MNAT1P51948 309 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 NNTQ13423 1086 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF394Q53GI3 561 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CAVIN4Q5BKX8 364 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 EMBQ6PCB8 327 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 NFXL1Q6ZNB6 911 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CHST3Q7LGC8 479 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC170Q8IYT3 715 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC155Q8N6L0 562 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 PAGR1Q9BTK6 254 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 KRT23Q9C075 422 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 RWDD2AQ9UIY3 292 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 FAM169AQ9Y6X4 670 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 TAF1P21675 1872 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFA10O95299 355 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 GYPCP04921 128 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 NPR1P16066 1061 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 PRLRP16471 622 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CDC27P30260 824 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF76P36508 570 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 IRAK1P51617 712 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 SMTNP53814 917 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA8FQ08AF8 430 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 DEFB132Q7Z7B7 95 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CNPY4Q8N129 248 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 C3orf20Q8ND61 904 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 OR8K1Q8NGG5 319 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CAGE1Q8TC20 777 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 EDEM1Q92611 657 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP7.98□□□□□ -1.132e-6■■■□□ 19
CTPS1-201ENST00000372616 CABS1Q96KC9 395 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 XDHP47989 1333 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ERICH2A1L162 156 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 H0YHG0 523 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 H7C1D1 291 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 PHACTR2O75167 634 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 MYL1P05976 194 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CTSHP09668 335 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 TNFRSF8P28908 595 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ADORA1P30542 326 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R2P41236 205 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 EPHB4P54760 987 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ANTXR2P58335 489 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CUL4BQ13620 913 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 MTF1Q14872 753 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ALX1Q15699 326 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 BCAS4Q8TDM0 211 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 OSBP2Q969R2 916 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CLIC6Q96NY7 704 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CITED4Q96RK1 184 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 RNF14Q9UBS8 474 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CEP83Q9Y592 693 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 MYH8P13535 1937 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 AKAP11Q9UKA4 1901 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM75PA6NK02 468 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 GPAA1O43292 621 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 FSBPO95073 299 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 KRT9P35527 623 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ATP2B2Q01814 1243 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 DGKZQ13574 1117 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 UBE3CQ15386 1083 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 NTRK3Q16288 839 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms