RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262067.4

TSPAN13-201, Transcript of tetraspanin 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN13, Length 2,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF280CQ8ND82 737 aa26.73■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 MYRIPQ8NFW9 859 aa26.73■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF507Q8TCN5 953 aa26.73■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa26.73■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 MFAP3LO75121 409 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 ARP10275 920 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP26.72■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 MUM1L1Q5H9M0 696 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 FAM26FQ5R3K3 315 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 FAM114A1Q8IWE2 563 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 AS3MTQ9HBK9 375 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 SPON1Q9HCB6 807 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 HOMER2Q9NSB8 354 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 RGL1Q9NZL6 768 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 MCF2L2Q86YR7 1114 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 TBC1D7Q9P0N9 293 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 ZHX2Q9Y6X8 837 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 DOCK1Q14185 1865 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 MYOCDQ8IZQ8 938 aa26.71■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa26.71■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 RPTORQ8N122 1335 aa26.71■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 PES1O00541 588 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 KRT18P05783 430 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 GHRHRQ02643 423 aa26.7■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 PPP2R5CQ13362 524 aa26.7■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF592Q92610 1267 aa26.7■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 KLRG1Q96E93 195 aa26.7■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 HSD17B14Q9BPX1 270 aa26.7■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF577Q9BSK1 485 aa26.7■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 B4DLN1 442 aa26.7■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 CHMP2AO43633 222 aa26.7■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 ZBED4O75132 1171 aa26.7■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 CNGA4Q8IV77 575 aa26.7■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 MXRA8Q9BRK3 442 aa26.7■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa26.7■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 FRMD3A2A2Y4 597 aa26.69■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 GAS7O60861 476 aa26.69■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 TPM1P09493 284 aa26.69■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 LRRC63Q05C16 580 aa26.69■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 WNK4Q96J92 1243 aa26.69■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.69■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 VWA5AO00534 786 aa26.69■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 CCP110O43303 1012 aa26.69■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 ITGB5P18084 799 aa26.69■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 SETQ01105 290 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 GIT2Q14161 759 aa26.69■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 REXO1L1PQ8IX06 675 aa26.69■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 IL31RAQ8NI17 732 aa26.69■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 ATG4CQ96DT6 458 aa26.69■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa26.69■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 A0A1W2PQC6 194 aa26.68■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 SLITRK3O94933 977 aa26.68■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 DNM2P50570 870 aa26.68■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 HMGCS2P54868 508 aa26.68■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa26.68■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 DYDC2Q96IM9 177 aa26.68■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 BHMT2Q9H2M3 363 aa26.68■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa26.68■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa26.68■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 SSC5DA1L4H1 1573 aa26.68■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 TRIM14Q14142 442 aa26.67■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 CCDC51Q96ER9 411 aa26.67■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 ZHX3Q9H4I2 956 aa26.67■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 TUFT1Q9NNX1 390 aa26.67■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 EYA4O95677 639 aa26.67■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 MIIPQ5JXC2 388 aa26.67■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 TPH2Q8IWU9 490 aa26.67■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 UNC45AQ9H3U1 944 aa26.67■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 SOWAHDA6NJG2 315 aa26.66■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 MTF1Q14872 753 aa26.66■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 TRERF1Q96PN7 1200 aa26.66■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 TSG101Q99816 390 aa26.66■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 REEP2Q9BRK0 252 aa26.66■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 ZSCAN12O43309 604 aa26.66■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 FDX1P10109 184 aa26.66■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 RPS6P62753 249 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 PRKG1Q13976 671 aa26.66■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 ZCWPW2Q504Y3 356 aa26.66■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 FOXR2Q6PJQ5 311 aa26.66■■□□□ 1.86
TSPAN13-201ENST00000262067 LRRC55Q6ZSA7 311 aa26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms