RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa25.48■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.48■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 PLA2G4BP0C869 781 aa25.48■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 DNM2P50570 870 aa25.48■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 SMCHD1A6NHR9 2005 aa25.47■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 SOWAHDA6NJG2 315 aa25.47■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 MSH4O15457 936 aa25.47■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 POLR2MP0CAP2 368 aa25.47■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 COASYQ13057 564 aa25.47■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 ABHD10Q9NUJ1 306 aa25.47■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 LRRC63Q05C16 580 aa25.46■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 ABCB11O95342 1321 aa25.46■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa25.46■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 EGFRP00533 1210 aa25.46■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 CFBP00751 764 aa25.46■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 MTF1Q14872 753 aa25.46■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 RAD9BQ6WBX8 426 aa25.46■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 PANK4Q9NVE7 773 aa25.46■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 VAV3Q9UKW4 847 aa25.46■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 RPA1P27694 616 aa25.45■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF76P36508 570 aa25.45■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 RBM10P98175 930 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 NCAPH2Q6IBW4 605 aa25.45■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.45■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.45■■□□□ 1.67
PDE4D-223ENST00000515011 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 SYCP1Q15431 976 aa25.45■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 GPBP1Q86WP2 473 aa25.45■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 CATSPER3Q86XQ3 398 aa25.45■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 TBC1D5Q92609 795 aa25.45■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 GINM1Q9NU53 330 aa25.45■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 POTEFA5A3E0 1075 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 B4DLN1 442 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC175P0C221 793 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 POTEIP0CG38 1075 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 CYP11B2P19099 503 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 PTGER2P43116 358 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 SLC12A3P55017 1021 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 FAM26FQ5R3K3 315 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 POTEGQ6S5H5 508 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 POTEEQ6S8J3 1075 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC65Q8IXS2 484 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 FEZ1Q99689 392 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 DESI2Q9BSY9 194 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 L2HGDHQ9H9P8 463 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 LDHDQ86WU2 507 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 TMTC1Q8IUR5 882 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 MYOCDQ8IZQ8 938 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 CYP2W1Q8TAV3 490 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.43■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 PES1O00541 588 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 MIIPQ5JXC2 388 aa25.43■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF710Q8N1W2 664 aa25.43■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.43■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 BCS1LQ9Y276 419 aa25.43■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 ADGRG1Q9Y653 693 aa25.43■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 FRMD3A2A2Y4 597 aa25.42■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 KRT9P35527 623 aa25.42■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.42■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 MICALL2Q8IY33 904 aa25.42■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 GLIS3Q8NEA6 775 aa25.42■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 DNAI1Q9UI46 699 aa25.42■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 WDR46O15213 610 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 LPAR1Q92633 364 aa25.42■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 TSG101Q99816 390 aa25.42■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 WDR18Q9BV38 432 aa25.42■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa25.42■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 TTC26A0AVF1 554 aa25.41■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 INPP5BP32019 993 aa25.41■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 LRRC41Q15345 812 aa25.41■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 LRRC55Q6ZSA7 311 aa25.41■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.41■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.41■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 CAPN11Q9UMQ6 739 aa25.41■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 ICAM1P05362 532 aa25.41■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 ERVK-24P63145 666 aa25.41■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 ZCWPW2Q504Y3 356 aa25.41■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 ARSHQ5FYA8 562 aa25.41■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 CYP26C1Q6V0L0 522 aa25.41■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 KCTD17Q8N5Z5 321 aa25.41■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 DNM3Q9UQ16 869 aa25.41■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 FZD9O00144 591 aa25.4■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
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